真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控：概念、策略與方法

前言
緒言
縮略詞
1真核基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的基礎(chǔ)知識
引言
基因調(diào)控的基本模型
概念和策略：Ⅰ啟動子和基本轉(zhuǎn)錄機構(gòu)
概念和策略：Ⅱ激活因子和抑制因子
概念和策略：Ⅲ染色質(zhì)和基因調(diào)控
概念和策略：Ⅳ增強體
2初始策略
引言
概念和策略
基因調(diào)控分析的首要步驟
達到特定目標(biāo)所需投入的時間和資源
論證分析的可行性
進行轉(zhuǎn)錄調(diào)控分析
總結(jié)
3MRNA豐度的調(diào)控模式
引言
概念和策略
轉(zhuǎn)錄起始與MRNA穩(wěn)定性
轉(zhuǎn)錄延伸
前提MRNA差異剪接.MRNA的轉(zhuǎn)運和多聚腺苷酸化
技術(shù)
4轉(zhuǎn)錄起始位點的定位
引言
概念和策略
初始階段需要考慮的問題
引物延伸
RNASE保護
S1核酸酶分析
CDNA末端的快速擴增
技術(shù)
5啟動子的功能性分析方法
引言
概念和策略
分析方法的選擇：各種分析方法的優(yōu)缺點
瞬時轉(zhuǎn)染分析
通過染色體整合的穩(wěn)定轉(zhuǎn)染分析
技術(shù)
哺乳動物細胞的常用轉(zhuǎn)染方法
常用的報道酶分析法
6遠距離調(diào)控區(qū)的鑒定和分析
引言
概念和策略
DNASEI超敏感性分析
基質(zhì)附著區(qū)的鑒定
遠距離調(diào)控區(qū)的功能性分析法
用語表征距離調(diào)控區(qū)的功能性分析
7鑒定調(diào)控區(qū)中的順式作用DNA元件
引言
概念和策略
通過綜合性突變分析鑒定調(diào)控元件
利用體內(nèi)或題外蛋白質(zhì)-DNA相互作用鑒定調(diào)控元件
通過數(shù)據(jù)庫分析鑒定調(diào)控元件
誘變技術(shù)
8DNA結(jié)合蛋白的鑒定及其基因的分離
引言
鑒定DNA結(jié)合蛋白的概念和策略
數(shù)據(jù)庫檢測法
粗制細胞裂解物的蛋白質(zhì)-DNA相互作喲內(nèi)分析方法的建立
克隆編碼DNA結(jié)合蛋白基因的概念和策略
通過蛋白質(zhì)純化法和肽序列分析法進行克隆
通過不需要進行蛋白質(zhì)-DNA相互作用分析的方法進行克隆
9確證蛋白質(zhì)-DNA相互作用的功能相關(guān)性
引言
概念和策略
體外蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合題的豐度
DNA結(jié)合蛋白和靶基因的相對表達模式
蛋白質(zhì)結(jié)合所需核苷酸和調(diào)控元件火星所需核苷酸的相關(guān)性
DNA結(jié)合蛋白的過量表達對報道基因或內(nèi)源基因的反式激活
與相鄰調(diào)控區(qū)相結(jié)合的蛋白質(zhì)間協(xié)同結(jié)合和協(xié)同效應(yīng)
基因組足跡模式和提外阻擊模式的比較
蛋白質(zhì)-DNA相互作用的相對親和力
基因剔除或反義實驗
顯性失活突變體
體外轉(zhuǎn)錄方法
體內(nèi)蛋白質(zhì)-DNA交聯(lián)
改變特異性的實驗
10內(nèi)源調(diào)控區(qū)的體內(nèi)分析
引言
概念和策略
序列特異性蛋白質(zhì)-DNA相互作用的體內(nèi)分析
核小體的定位和重建
DNA甲基化
基因的亞核定位
技術(shù)
11合成重組轉(zhuǎn)錄因子的方法
引言
概念和策略
原核表達體系
克服E.COLI中表達問題的策略
合成大的調(diào)控蛋白
合成小量的粗制蛋白質(zhì)
大分子符合體的合成與純化
適當(dāng)表達體系的選擇
12鑒定和分析轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)域
引言
概念和策略：定義結(jié)構(gòu)域
誘變的基本原理
基因激活因子的機構(gòu)域
分離激活因子的DNA結(jié)合機構(gòu)域和激活結(jié)構(gòu)域
DNA識別亞結(jié)構(gòu)域和寡聚化亞結(jié)構(gòu)域的劃分
概念和策略：蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用
激活結(jié)構(gòu)域和共激活因子及通用因子的相互作用
親和層喜
改變特異性的遺傳體系
基本轉(zhuǎn)錄機構(gòu)的結(jié)構(gòu)-功能分析
技術(shù)
13調(diào)節(jié)性轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合DNA的理論.特征和模型
引言
概念和策略
DNA-蛋白質(zhì)相互作用的基本理論和實例
DNA-蛋白質(zhì)相互作用的分析和模型
啟動子特異性多組分核蛋白復(fù)合體的分析
技術(shù)
14用于體起轉(zhuǎn)錄分析的粗制系統(tǒng)和分級分離系統(tǒng)
引言
概念和策略
抽提物的制備
轉(zhuǎn)錄分析
分級分離系統(tǒng)
技術(shù)
核抽提物和全細胞抽提物的制備
體外轉(zhuǎn)錄分析
轉(zhuǎn)錄因子的純化
15研究轉(zhuǎn)錄復(fù)合體組裝的方法
引言
概念和策略
基本前起始復(fù)合體的形成
開放復(fù)合體的形成.起始和啟動子撤離
活化的復(fù)合體在啟動子的組裝
技術(shù)
附錄
附錄1注意事項
附錄2供應(yīng)商
附錄3商標(biāo)