軟物質的計算機模擬與理論方法

1 高分子鏈聚合初生態(tài)的結晶
1.1 高分子鏈的“初生態(tài)”
1.2 鏈生長分子動力學方法
1.3 GCMD方法的驗證
1.4 聚乙烯單鏈初生態(tài)結構的研究
1.4.1 單鏈在表面上生長過程的兩個階段
1.4.2 晶干在伸長過程中的協(xié)同運動
1.4.3 初生態(tài)單分子鏈的折疊機理
1.5 聚乙烯多鏈體系初生態(tài)結構的研究
1.5.1 不同活性點密度的體系的形貌發(fā)展
1.5.2 不同活性點密度的體系的結構分析
1.6 總結
參考文獻
2 高分子鏈的穿插與結晶
2.1 非平衡態(tài)高分子鏈的纏結問題和鏈纏結的結構屬性
2.2 高分子鏈的穿插程度
2.3 表面與本體的穿插程度
2.4 纏結對結晶的影響
2.5 位點序參數(shù)
2.5.1 位點序參數(shù)方法
2.5.2 臨界成核位點序參數(shù)值
2.6 穿插程度與結晶的關系
2.6.1 整體穿插程度與結晶速率
2.6.2 局部穿插程度與成核的分布
2.6.3 局部成核與生長過程
2.7 總結
附錄一 建模與模擬細節(jié)
附錄二 ICF與SOP的算法探討
參考文獻
3 聚合物的粗?；Ｐ?br />3.1 介紹
3.2 普適的粗粒化模型
3.2.1 粒子基粗?；Ｐ?br />3.2.2 場基粗粒化模型
3.3 系統(tǒng)的粗?；Ｐ?br />3.4 應用實例
3.5 總結與展望
參考文獻
4 團簇結構優(yōu)化算法與應用
4.1 引言
4.2 無偏優(yōu)化算法用于團簇的結構優(yōu)化
4.2.1 遺傳算法
4.2.2 快速退火演化算法
4.2.3 隨機隧道算法
4.3 基于格點搜索的團簇優(yōu)化方法
4.3.1 格點的建立
4.3.2 格點搜索
4.3.3 應用舉例
4.4 動態(tài)格點搜索算法
4.4.1 動態(tài)格點
4.4.2 動態(tài)格點搜索算法
4.4.3 動態(tài)格點搜索算法的改進
4.4.4 應用舉例
參考文獻
5 雜化蒙特卡羅和廣義系綜模擬方法
5.1 背景簡介
5.2 雜化蒙特卡羅方法
5.2.1 針對問題及特點
5.2.2 算法實現(xiàn)
5.2.3 應用實例和注意事項
5.2.4 雜化蒙特卡羅方法優(yōu)缺點
5.3 廣義系綜模擬方法
5.3.1 針對問題及特點
5.3.2 并行回火方法
5.3.3 多正則系綜方法
5.4 總結
參考文獻
6 構象態(tài)躍遷行為與玻璃化轉變
6.1 聚合物構象能
6.1.1 單鍵的構象能
6.1.2 一對鍵的構象能
6.2 聚合物本體的模擬
6.3 聚合物本體性質
6.3.1 聚合物玻璃化轉變溫度及分子鏈結構
6.4 構象分布與表觀構象能_
6.4.1 聚合物鏈的松弛行為
6.5 玻璃化轉變前后構象躍遷行為的變化
6.5.1 構象躍遷
6.5.2 躍遷速率和活化能在玻璃化轉變溫度附近的變化
6.5.3 玻璃態(tài)聚合物構象躍遷的非均質現(xiàn)象
6.5.4 躍遷的起始角和旋轉角
6.5.5 構象“凍結”比例
6.5.6 玻璃化轉變過程中構象熵的變化
參考文獻
7 表面活性劑與泡沫的穩(wěn)定性
7.1 表面活性劑在氣液界面的動態(tài)行為
7.1.1 模擬參數(shù)及過程
7.1.2 純水氣液界面的模擬結果
7.1.3 表面活性劑在氣液界面的動態(tài)行為以及性質
7.2 模擬研究表面活性劑對泡沫的穩(wěn)定性
7.2.1 模擬模型
7.2.2 臨界膜厚的定義及尺度對結果的影響
7.2.3 穩(wěn)定指數(shù)
7.2.4 表面活性劑的效率與泡沫的穩(wěn)定性
參考文獻
8 分子力學力場及參數(shù)化方法
8.1 引言
8.2 基本原理
8.2.1 鍵伸縮項
8.2.2 鍵角彎曲項
8.2.3 二面角扭轉項
8.2.4 偏離平面振動項
8.2.5 非正常二面角扭轉項
8.2.6 范德華相互作用項
8.2.7 庫侖作用項
8.3 經(jīng)驗參數(shù)化方法
8.3.1 MM3系列力場
8.3.2 AMBER力場
8.3.3 CHARMM力場
8.4 基于量子化學計算的參數(shù)化方法
8.4.1 CFF力場
8.4.2 MMFF系列力場
8.4.3 Direct Force Field
8.5 成功應用于凝聚相的關鍵問題
8.5.1 OPLS力場
8.5.2 COMPASS力場
8.5.3 TraPPE力場
8.6 普適的經(jīng)驗力場
8.6.1 Dreiding力場
8.6.2 覆蓋全周期表元素的UFF力場
8.7 極化力場
8.8 反應力場
參考文獻
9 耗散粒子動力學的原理與應用
9.1 耗散粒子動力學簡介
……
10 模擬表面活性劑體系的介觀力場方法
11 自洽平均場理論方法
參考文獻