水產(chǎn)基因組技術與研究進展

第一章 大片段基因組文庫的構建、質量鑒定和應用
第一節(jié) 大片段基因組文庫發(fā)展概述
第二節(jié) 大片段基因組文庫的構建
一、HMW DNA的制備
二、HMW DNA部分酶切和片段選擇
三、載體的制備
四、連接和轉化
五、克隆的挑取與保存
六、目的克隆的篩選
第三節(jié) 文庫的質量鑒定
一、文庫插入片段的平均大小和基因組覆蓋率
二、文庫的空載率、嵌合率和細胞器DNA污染
三、文庫的穩(wěn)定性檢測
第四節(jié) 大片段基因組文庫的應用
一、基因和數(shù)量性狀位點(QTL)的圖位克隆
二、基因組物理圖譜的構建
三、全基因組測序
四、功能基因組分析
五、比較基因組學研究
第五節(jié) 大片段基因組文庫在水產(chǎn)生物基因組研究中的應用和展望
第二章 物理圖譜構建技術及其在水產(chǎn)生物基因組研究中的應用
第一節(jié) 物理圖譜構建技術
一、黏粒文庫酶切指紋制備
二、BAC文庫酶切指紋圖譜的制備
三、物理圖譜的裝配
四、物理圖譜的驗證策略
第二節(jié) 物理圖譜在基因組學研究中的應用
一、物理圖譜與遺傳圖譜的整合
二、基于物理圖譜的全基因組測序策略
三、重要基因的圖位克隆
四、基于物理圖譜的比較基因組學研究
第三節(jié) 物理圖譜構建技術最新進展
第四節(jié) 高信息含量BAC酶切指紋圖譜采集實驗流程
一、BAC克隆DNA提取實驗流程
二、HICF技術流程
第三章 水產(chǎn)生物遺傳作圖
第一節(jié) 作圖群體的選擇
一、親本的選擇
二、分離群體類型的選擇
三、群體大小的選擇
第二節(jié) 干涉和作圖函數(shù)
一、干涉
二、作圖函數(shù)
第三節(jié) F2、BC和DH群體標記位點間重組率的估算
一、兩個標記位點間重組率的估算
二、多位點連鎖分析方法和排序
三、基因型分型錯誤率及缺失率對連鎖圖譜的影響
第四節(jié) 遠緣雜交群體的連鎖分析
一、全同胞家系分離標記的特點
二、擬測交策略
三、構建F1群體遺傳連鎖圖譜的統(tǒng)計分析步驟
四、構建F1群體遺傳連鎖圖譜的軟件
第五節(jié) 遺傳圖譜整合
一、分子圖譜之間的整合
二、物理圖譜和連鎖圖譜整合
……
第四章 全基因組測序：水產(chǎn)生物基因組資源的全面開發(fā)
第五章 熒光原位雜交作圖
第六章 系統(tǒng)發(fā)育基因組學
第七章 比較基因組學在水產(chǎn)生物基因組學研究中的應用
第八章 轉錄組嘗試測序技術
第九章 生物芯片與水產(chǎn)生物功能基因組學研究
第十章 數(shù)字基因表達譜技術
第十一章 魚類免疫功能基因研究
第十二章 非編碼RNA
第十三章 常用分子標記
第十四章 分子遺傳與保護生物學
第十五章 水產(chǎn)動物轉基因技術
第十六章 魚類轉座子介導的轉基因和基因捕獲策略