全書分為四個部分:第一部分的手跡主要反映陳云在1949年以前的革命生涯,包括他在商務印書館當學徒、走上革命道路、領導農民暴動等內容;第二部分的手跡主要反映了陳云在1949年以后改革開放之前關心和參加新中國各項事業(yè)建設,包括領導經濟戰(zhàn)線的工作、關心國家基本建設、關注軍隊建設等內容;第三部的手跡主要反映了陳云在改革開放新時期關心國家各項事業(yè)發(fā)展,包括關心文化、農業(yè)等工作,呼吁提拔青年干部,懷念毛澤東、劉少奇等老戰(zhàn)友,提倡保護環(huán)境等內容;第四部分的手跡帶有總結性質,所反映內容貫穿了陳云的一生,包括重視調查研究、面對逆境不妥協、提倡不斷學習等內容。此外,每幅手跡的故事具有一定的時間跨度,再加上很多手跡書寫的時間并不是與所反映的事件一一對應,因此,經與中共中央文獻研究室的專家商定,本書的隔頁不取標題,也不用時間段加以注明。書稿篇章的排列順序,以手跡所反映事件的時間為序。