食品及動(dòng)植物產(chǎn)品DNA分子鑒定技術(shù)

目錄
前言
第一章 食品及動(dòng)植物產(chǎn)品DNA提取和純化技術(shù) 1
第一節(jié) DNA提取概述 1
第二節(jié) 糧谷類(lèi)制品DNA提取方法 1
一、mUREA法 2
二、改良CTAB法 3
三、改良SDS法 3
第三節(jié) 牛羊肉類(lèi)DNA提取方法 4
一、改良鹽析法 4
二、柱層析法 5
三、SDS方法 6
四、改進(jìn)方法 6
五、PEF法 6
六、微波法 7
第四節(jié) 乳制品類(lèi)DNA提取方法 8
一、CTAB法 8
二、異硫氰酸胍結(jié)合苯酚/氯仿法 8
三、磁珠法 9
四、玻璃珠吸附法 10
五、液氮研磨法 10
六、CTAB-SDS凍融法 10
七、酚/氯仿抽提法 11
第五節(jié) 果蔬類(lèi)制品DNA提取方法 11
一、CTAB法 11
二、SDS-CTAB 法 12
三、改良CTAB法 13
四、改良SDS法 13
五、改良試劑盒法 14
六、簡(jiǎn)易法 14
第六節(jié) 中藥材DNA提取方法 15
一、改良高鹽低pH法 15
二、改良SDS法 16
三、CTAB法 16
四、PVP法 17
五、苯酚法 17
六、堿裂解法 18
第七節(jié) 茶葉及其制品DNA提取方法 18
一、傳統(tǒng)CTAB法 18
二、改良CTAB法 19
三、SDS/硅膠吸附柱法 20
四、改良SDS法 21
第八節(jié) 油脂類(lèi)制品DNA提取方法 21
一、優(yōu)化后的CTAB法 21
二、離心柱法 22
三、改良SDS法 22
四、高鹽低pH法 23
五、冷凍干燥法 23
六、改進(jìn)樹(shù)脂法 24
七、國(guó)標(biāo)法 24
八、大量富集法 24
九、直接抽提法 25
十、上清重復(fù)離心法 25
第九節(jié) 水產(chǎn)品DNA提取方法 25
一、魚(yú)類(lèi)肌肉DNA提取方法 26
二、蝦類(lèi)肌肉DNA提取方法 27
三、貝類(lèi)DNA提取方法 28
四、藻類(lèi)DNA提取方法 30
第十節(jié) DNA的定量和純度測(cè)定 33
一、紫外光譜分析的原理 34
二、操作步驟 34
參考文獻(xiàn) 34
第二章 DNA分子鑒定技術(shù) 36
第一節(jié) DNA分子標(biāo)記概述 36
第二節(jié) 限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)標(biāo)記 36
一、RFLP標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn) 38
二、RFLP標(biāo)記技術(shù)的操作 38
第三節(jié) 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(RAPD)標(biāo)記 40
一、RAPD標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn) 41
二、RAPD標(biāo)記技術(shù)的操作 42
三、實(shí)驗(yàn)中可能發(fā)生的問(wèn)題及其解決的方法 43
第四節(jié) 序列特征擴(kuò)增區(qū)(SCAR)標(biāo)記 44
一、SCAR標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn) 45
二、SCAR標(biāo)記技術(shù)的操作 45
第五節(jié) 簡(jiǎn)單重復(fù)序列(SSR)標(biāo)記 46
一、SSR標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn) 46
二、SSR標(biāo)記技術(shù)的操作步驟 47
第六節(jié) 簡(jiǎn)單重復(fù)序列區(qū)間(ISSR)標(biāo)記 48
一、ISSR標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn) 49
二、ISSR標(biāo)記技術(shù)的操作 50
第七節(jié) 擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)標(biāo)記 50
一、AFLP標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn) 51
二、AFLP標(biāo)記技術(shù)的操作 52
三、AFLP多態(tài)性的檢測(cè)方法 54
四、cDNA-AFLP 55
第八節(jié) 表達(dá)序列標(biāo)簽(EST)標(biāo)記 55
一、EST標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn) 56
二、EST標(biāo)記的產(chǎn)生過(guò)程 57
三、EST數(shù)據(jù)庫(kù) 58
第九節(jié) 單核苷酸多態(tài)性(SNP)標(biāo)記 60
一、SNP標(biāo)記技術(shù)的特點(diǎn) 61
二、SNP研究的內(nèi)容和檢測(cè)方法 62
第十節(jié) 序列標(biāo)簽位點(diǎn)(STS)標(biāo)記 65
第十一節(jié) 單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)標(biāo)記 65
一、SSCP標(biāo)記的優(yōu)點(diǎn) 66
二、SSCP分析的缺點(diǎn) 66
三、SSCP的實(shí)驗(yàn)操作 66
第十二節(jié) 基于反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的分子標(biāo)記 68
一、反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的結(jié)構(gòu)和類(lèi)型 68
二、反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的特點(diǎn) 69
三、反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子的分子標(biāo)記 69
第十三節(jié) DNA條形碼技術(shù) 69
一、DNA條形碼序列的選擇 70
二、DNA條形碼應(yīng)用于物種鑒定存在的問(wèn)題 70
第十四節(jié) 熒光定量PCR技術(shù) 71
一、熒光定量PCR定量的理論模式 72
二、熒光閾值和C t值 72
三、熒光定量PCR技術(shù)的特點(diǎn) 74
第十五節(jié) 環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)技術(shù) 75
一、LAMP技術(shù)的原理 75
二、反應(yīng)體系 76
三、結(jié)果判斷 76
第十六節(jié) 焦磷酸測(cè)序技術(shù) 77
一、焦磷酸測(cè)序技術(shù)的一般原理 77
二、焦磷酸測(cè)序的反應(yīng)過(guò)程 77
第十七節(jié) 變性高效液相色譜(DHPLC)技術(shù) 79
一、單核苷酸多態(tài)性分析原理 79
二、基因型多態(tài)性分析原理 80
三、溫度工作原理 81
四、DHPLC實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及影響要素 81
第十八節(jié) 變性梯度凝膠電泳(DGGE)技術(shù) 81
一、DGGE的衍生技術(shù) 82
二、PCR-DGGE方法的優(yōu)點(diǎn) 83
第十九節(jié) 基因芯片技術(shù) 84
一、基因芯片的基本分類(lèi) 85
二、基因芯片的檢測(cè)方法 85
三、掃描閱讀 87
第二十節(jié) 數(shù)字PCR(dPCR)技術(shù) 87
一、dPCR的特點(diǎn) 88
二、dPCR的類(lèi)型 89
三、dPCR在食品及動(dòng)植物產(chǎn)品分子鑒定上的應(yīng)用現(xiàn)狀 90
四、問(wèn)題與展望 91
參考文獻(xiàn) 92
第三章 DNA分子鑒定技術(shù)在食品和動(dòng)植物產(chǎn)品鑒定中的應(yīng)用 95
第一節(jié) DNA分子鑒定技術(shù)在糧油制品上的應(yīng)用 95
一、谷物類(lèi)及其制品鑒定 95
二、油料作物及其制品鑒定 112
第二節(jié) DNA分子鑒定技術(shù)在果蔬制品上的應(yīng)用 124
一、汁制品分子鑒定研究現(xiàn)狀 124
二、釀造制品分子鑒定研究現(xiàn)狀 134
三、腌制品分子鑒定研究現(xiàn)狀 140
第三節(jié) DNA分子鑒定技術(shù)在肉制品上的應(yīng)用 140
一、肉制品鑒別技術(shù) 142
二、肉制品溯源 157
第四節(jié) DNA分子鑒定技術(shù)在乳制品上的應(yīng)用 160
一、RFLP 160
二、RAPD 161
三、AFLP 161
四、其他分子標(biāo)記技術(shù) 162
第五節(jié) DNA分子鑒定技術(shù)在水產(chǎn)品上的應(yīng)用 168
一、PCR-FINS 170
二、PCR-RFLP 171
三、PCR-SSCP 172
四、熒光定量PCR 172
五、DNA條形碼 173
六、DNA芯片 174
第六節(jié) DNA分子鑒定技術(shù)在茶類(lèi)及其制品中的應(yīng)用 176
一、RFLP圖譜 177
二、CAPS圖譜 177
三、RAPD圖譜 178
四、SCAR圖譜 181
五、AFLP圖譜 183
六、ISSR圖譜 185
七、SSR圖譜 188
八、SNP圖譜 190
第七節(jié) DNA分子鑒定技術(shù)在中藥材上的應(yīng)用 190
一、植物藥材分子鑒定研究現(xiàn)狀 190
二、動(dòng)物藥材分子鑒定研究現(xiàn)狀 205
第八節(jié) DNA分子鑒定技術(shù)在轉(zhuǎn)基因食品上的應(yīng)用 210
一、轉(zhuǎn)基因食品簡(jiǎn)介 210
二、轉(zhuǎn)基因食品潛在風(fēng)險(xiǎn)與安全評(píng)估 211
三、轉(zhuǎn)基因食品的檢測(cè) 212
參考文獻(xiàn) 217