梅花基因組學研究（精）

前言
第1章 梅花全基因組測序及精細圖譜構建
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結果
2．1 梅花基因組測序策略與原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計
2．2 K-mer分析估算梅花基因組大小
2．3 梅花基因組初步組裝
2．4 基因組GC含量分析
2．5 WGM數(shù)據(jù)輔助基因組組裝
2．6 錨定基因組組裝序列
2．7 梅花不同器官轉錄組測序
2．8 梅花全基因組注釋
2．9 梅花基因組進化分析
2．10 薔薇科祖先染色體構建
2．11 梅花花香機制研究
2．12 梅花低溫開花機制研究
3 結論
參考文獻
附表 部分植物基因組測序
第2章 梅花重要品種重測序與全基因組關聯(lián)分析
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結果
2．1 梅花基因組重測序和遺傳變異挖掘
2．2 梅花群體遺傳學分析
2．3 杏和李的基因滲入
2．4 梅花和李屬近緣物種的泛基因組分析
2．5 梅花10個觀賞性狀的GWAS分析
3 結論
參考文獻
第3章 梅花遺傳圖譜構建與重要性狀QTL定位
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結果
2．1 梅花遺傳作圖群體構建
2．2 梅花遺傳框架圖譜構建
2．3 梅花高密度遺傳圖譜構建與生長性狀的QTL定位
2．4 梅花基因組與李屬參考圖間共線性分析
2．5 梅花高密度遺傳圖譜及垂枝性狀QTL定位
2．6 梅花重要性狀定位分析
2．7 梅花垂枝性狀精細定位及候選基因篩選
3 結論
參考文獻
第4章 梅花花香分子機理研究
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結果
2．1 李屬花香揮發(fā)物成分與遺傳變異分析
2．2 杏梅和櫻李梅特征花香缺失分析
2．3 梅花花香主要揮發(fā)性成分時空揮發(fā)模式
2．4 ‘三輪玉碟’不同開花時期比較轉錄組測序分析
2．5 梅花盛花期不同花器官基因表達模式分析
2．6 梅花‘三輪玉碟’花全長轉錄本測序
2．7 梅花花香調(diào)控MYB基因克隆與功能分析
2．8 梅花BAHD家族基因克隆與功能驗證
3 結論
參考文獻
第5章 梅花花發(fā)育分子機理研究
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結果
2．1 梅花花發(fā)育sRNA轉錄組及miRNA表達分析
2．2 梅花休眠相關DELLA基因克隆與功能分析
2．3 梅花花器官發(fā)育相關MADS-box基因功能分析
3 結論
參考文獻
第6章 梅花花色分子機理研究
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結果
2．1 梅花花色表型測定
2．2 梅花花青素苷成分鑒定
2．3 梅花花青素苷定量分析
2．4 梅花花青素苷組成與花色參數(shù)關系分析
2．5 梅花R2R3-MYB基因家族分析
2．6 梅花R2R3-MYB基因功能分析
3 結論
參考文獻
第7章 梅花抗寒分子機理研究
1 材料與方法
1．1 材料
1．2 方法
2 研究結果
2．1 梅花PmICE1基因功能分析
2．2 梅花PmLEA基因功能分析
2．3 梅花PmDAM和PmCBF基因功能分析
3 結論
參考文獻