泛素家族介導的蛋白質降解和細胞自噬

目錄
第一章 泛素家族概論 1
第一節(jié) 泛素家族概述 1
第二節(jié) 泛素家族異常與人類疾病 4
第三節(jié) 溶酶體-自噬通路及其在蛋白質降解中的作用 5
第四節(jié) 泛素研究的背景與前景 7
第五節(jié) 小結 11
參考文獻 11
第一篇 泛素-蛋白酶體通路
第二章 泛素化概論 15
第一節(jié) 泛素化的生物化學基礎 15
第二節(jié) 泛素密碼 25
第三節(jié) 泛素化修飾及其生物學功能 32
第四節(jié) 蛋白質翻譯后修飾之間的對話 36
參考文獻 40
第三章 泛素和類泛素激活酶 42
第一節(jié) 概述 42
第二節(jié) 泛素激活酶的表達和純化 44
第三節(jié) 人類擬泛素激活酶APPBP1/UBA3異二聚體復合物的表達和純化 44
第四節(jié) 激活酶UBE1L的表達和純化 48
參考文獻 49
第四章 泛素耦合酶 51
第一節(jié) 概述 51
第二節(jié) 泛素耦合酶UBC4/5家族的表達和純化 55
第三節(jié) 泛素耦合酶Cdc34、UBC13和MMS2的表達及純化 59
第四節(jié) 檢測泛素耦合酶-泛素硫酯中間產(chǎn)物形成的高通量方法 63
參考文獻 66
第五章 泛素連接酶 68
第一節(jié) 概述 68
第二節(jié) 實驗技術 79
參考文獻 137
第六章 泛素結合蛋白 140
第一節(jié) 泛素結合蛋白的特性和種類 141
第二節(jié) 泛素結合蛋白的功能 144
第三節(jié) 泛素結合蛋白與人類疾病 146
第四節(jié) 泛素結合結構域分析方法 147
參考文獻 164
第七章 去泛素化酶 166
第一節(jié) 去泛素化酶的分類 166
第二節(jié) 去泛素化酶的作用機制 168
第三節(jié) 去泛素化酶的生理和病理功能 171
參考文獻 173
第八章 相素化修飾 175
第一節(jié) 相素化修飾的生物學作用 175
第二節(jié) 相素化修飾及相關酶 177
第三節(jié) 相素化修飾相關基因敲除模型 181
第四節(jié) 相素化修飾與人類疾病 183
第五節(jié) 蛋白質相素化修飾分析方法 185
第六節(jié) 相素耦合酶UBC9的表達、純化和活性鑒定 187
第七節(jié) 熒光共振能量轉移方法分析相素化修飾 190
第八節(jié) 小結 195
參考文獻 195
第九章 擬素化修飾 198
第一節(jié) 概述 198
第二節(jié) 擬素化修飾的蛋白底物 199
第三節(jié) 擬素化修飾與腫瘤 200
第四節(jié) UBC12介導的擬素修飾實驗 206
第五節(jié) COP9信號體（CSN）的純化 207
第六節(jié) 展望 224
參考文獻 224
第十章 植物蛋白質的泛素化修飾 228
第一節(jié) 概述 228
第二節(jié) 植物體外泛素化檢測修飾研究方法 231
第三節(jié) 植物體內快速高效檢測蛋白泛素化修飾研究方法 238
參考文獻 251
第十一章 植物蛋白質的相素化修飾 253
第一節(jié) 概述 253
第二節(jié) 實驗技術 255
參考文獻 260
第十二章 泛素化蛋白的質譜法鑒定 262
第一節(jié) 概述 262
第二節(jié) 泛素化蛋白的富集 264
第三節(jié) 泛素化蛋白的分離 271
第四節(jié) 泛素化蛋白的驗證與定量 274
第五節(jié) 實驗技術 277
參考文獻 288
第十三章 泛素化修飾與表觀遺傳調控 290
第一節(jié) 概述 290
第二節(jié) 組蛋白泛素化的研究技術 292
第三節(jié) 組蛋白去泛素化的研究技術 294
參考文獻 300
第十四章 泛素化修飾調控細胞代謝 302
第一節(jié) 泛素化修飾與糖代謝 302
第二節(jié) 泛素化修飾與脂質代謝 316
第三節(jié) 泛素化修飾調控氨基酸代謝 328
第四節(jié) 泛素化調控核酸代謝 336
第五節(jié) 代謝相關的信號通路與泛素化修飾 342
第六節(jié) 小結與展望 354
參考文獻 355
第十五章 泛素化修飾與細胞周期調控 357
第一節(jié) 概述 357
第二節(jié) 細胞周期的泛素化修飾調控 361
第三節(jié) 泛素化修飾異常與人類疾病 378
第四節(jié) 實驗技術 383
參考文獻 388
第十六章 泛素化調節(jié)細胞死亡 389
第一節(jié) 細胞凋亡概述 389
第二節(jié) 細胞凋亡的調控 391
第三節(jié) 程序性壞死 408
第四節(jié) 泛素化調控決定細胞命運走向 409
第五節(jié) 凋亡檢測方法 411
參考文獻 415
第十七章 泛素化修飾調控固有免疫信號通路 418
第一節(jié) 泛素化修飾在TLR信號通路中的功能 418
第二節(jié) 泛素化修飾在RLR信號通路中的功能 422
第三節(jié) 泛素化修飾在NLR信號通路中的功能 427
第四節(jié) 泛素化修飾在STING依賴的信號通路中的功能 430
第五節(jié) 展望 432
參考文獻 432
第十八章 蛋白酶體的結構與功能 435
第一節(jié) 蛋白酶體的組成與結構 435
第二節(jié) 蛋白酶體的作用機制 440
參考文獻 447
第十九章 蛋白酶體的活性測定與純化 449
第一節(jié) 蛋白酶體的活性測定 449
第二節(jié) 蛋白酶體及其激活物的純化與分析 482
參考文獻 496
第二十章 泛素-蛋白酶體通路與藥物研發(fā) 498
第一節(jié) 概述 498
第二節(jié) 靶向泛素-蛋白酶體系統(tǒng)的小分子抑制劑 500
第三節(jié) PROTAC技術 518
第四節(jié) 靶向泛素系統(tǒng)的藥物研發(fā)策略 527
第五節(jié) 針對蛋白酶體的藥物研發(fā) 533
第六節(jié) 展望 543
參考文獻 544
第二篇 細胞自噬
第二十一章 細胞自噬概論 549
第一節(jié) 概述 549
第二節(jié) 自噬研究的歷史 551
第三節(jié) 自噬的分子機制 554
第四節(jié) 自噬在生理學與疾病中的作用 564
參考文獻 570
第二十二章 自噬的選擇性 577
第一節(jié) 概述 577
第二節(jié) 與Atg8/LC3結合的受體蛋白 578
第三節(jié) 與Atg5結合的受體蛋白 585
第四節(jié) 分子伴侶介導的自噬的選擇性降解 586
第五節(jié) 小結與展望 588
參考文獻 588
第二十三章 泛素及類泛素信號對自噬的調控 592
第一節(jié) 類泛素蛋白介導自噬小體的形成及底物識別 592
第二節(jié) 泛素介導自噬受體構象改變和自噬受體復合物形成 594
第三節(jié) 泛素介導自噬小體形成和受體對底物的識別 596
第四節(jié) 泛素調控底物轉運和自噬性降解 597
參考文獻 599
第二十四章 蛋白聚集體自噬 601
第一節(jié) 概述 601
第二節(jié) 聚集體的形成、轉運、識別和調控 602
第三節(jié) 聚集體自噬障礙與疾病 607
第四節(jié) 展望 611
參考文獻 611
第二十五章 線粒體和細胞器自噬 614
第一節(jié) 線粒體和其他細胞器自噬 614
第二節(jié) 細胞器自噬的實驗技術 622
參考文獻 632
第二十六章 自噬與腫瘤 635
第一節(jié) 自噬抑制腫瘤的發(fā)生發(fā)展 635
第二節(jié) 自噬促進腫瘤發(fā)生發(fā)展的作用 637
第三節(jié) 自噬在腫瘤治療中的應用 640
參考文獻 642
第二十七章 酵母自噬研究方法 644
第一節(jié) GFP-Atg8剪切實驗 644
第二節(jié) Pho8Δ60堿性磷酸酶實驗 647
第三節(jié) Ape1的成熟 649
第四節(jié) Ape1的動力學研究 650
第五節(jié) 活細胞觀察GFP-Atg8的循環(huán)周期 653
第六節(jié) 在atg1ts菌株中Atg9的運輸 655
參考文獻 657
第二十八章 線蟲的自噬過程及分子機制 659
第一節(jié) 概述 659
第二節(jié) 線蟲中的細胞自噬 659
第三節(jié) 線蟲中的自噬實驗技術 666
參考文獻 672
第二十九章 自噬在臨床的應用 675
第一節(jié) 自噬相關的藥物分類 675
第二節(jié) 自噬相關藥物作用的信號通路 682
第三節(jié) 自噬相關藥物在臨床的應用前景 689
參考文獻 695
附錄一 主要專業(yè)名詞英漢對照 699
附錄二 編委簡介 707