大數(shù)據(jù)時(shí)代的生物技術(shù)和農(nóng)業(yè)

目錄
第1章 大數(shù)據(jù)的來(lái)源 1
1.1 大數(shù)據(jù)的概念及類(lèi)型 1
1.1.1 生物學(xué)和醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù) 2
1.1.2 農(nóng)業(yè)大數(shù)據(jù) 6
1.2 人類(lèi)基因組計(jì)劃 12
1.2.1 DNA雙螺旋的魔力 13
1.2.2 解碼“生命天書(shū)” 15
1.3 大數(shù)據(jù)對(duì)生命科學(xué)的影響 19
1.3.1 生物信息學(xué)的概念 20
1.3.2 生物信息學(xué)的誕生和發(fā)展 21
1.3.3 信息資源與生命科學(xué)研究 23
1.3.4 計(jì)算機(jī)時(shí)代的生物學(xué) 24
1.4 了解基因組數(shù)據(jù)庫(kù)和生物信息學(xué) 26
1.4.1 生物信息學(xué)研究的主要推動(dòng)力 26
1.4.2 特定基因組資源 34
1.4.3 疾病基因組資源 37
1.4.4 DNA序列分析 39
1.4.5 尋找序列之間的差異 44
1.4.6 多序列比對(duì) 49
1.4.7 二次數(shù)據(jù)庫(kù)搜索 53
1.4.8 常見(jiàn)的生物信息學(xué)分析軟件 54
第2章 生物醫(yī)學(xué)的變革 57
2.1 個(gè)體基因組時(shí)代即將來(lái)臨 57
2.1.1 尋找人類(lèi)遺傳疾病的根源 57
2.1.2 全基因組關(guān)聯(lián)研究及存在的問(wèn)題 58
2.1.3 eQTL作圖 63
2.1.4 挑戰(zhàn)與策略 64
2.2 個(gè)性化醫(yī)學(xué) 66
2.2.1 個(gè)體遺傳差異 67
2.2.2 個(gè)性化醫(yī)學(xué)的意義 67
2.2.3 如何實(shí)現(xiàn)個(gè)性化醫(yī)療服務(wù) 68
2.3 大數(shù)據(jù)將顛覆傳統(tǒng)醫(yī)學(xué) 69
2.3.1 傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)模式的弊端 69
2.3.2 醫(yī)患關(guān)系 70
2.3.3 醫(yī)學(xué)互聯(lián)網(wǎng)的出現(xiàn) 74
2.3.4 移動(dòng)醫(yī)療 77
2.3.5 顛覆傳統(tǒng)醫(yī)學(xué) 78
第3章 大數(shù)據(jù)對(duì)制藥公司的影響 85
3.1 藥靶的篩選 85
3.1.1 藥物基因組學(xué) 87
3.1.2 大數(shù)據(jù)如何給藥物研發(fā)帶來(lái)新革命 89
3.1.3 未來(lái)的場(chǎng)景 90
3.2 藥物的個(gè)體差異 90
3.3 基于大數(shù)據(jù)的藥物設(shè)計(jì) 92
3.3.1 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì) 92
3.3.2 計(jì)算機(jī)輔助疫苗設(shè)計(jì) 95
3.3.3 藥物研發(fā)的大數(shù)據(jù)處方 101
3.3.4 大數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)變面臨的挑戰(zhàn) 105
第4章 大數(shù)據(jù)引發(fā)農(nóng)業(yè)的變革 108
4.1 何為農(nóng)業(yè)大數(shù)據(jù) 108
4.2 大數(shù)據(jù)對(duì)農(nóng)業(yè)的影響 108
4.2.1 種質(zhì)創(chuàng)新 109
4.2.2 精準(zhǔn)農(nóng)業(yè) 113
4.2.3 食物追蹤 114
4.2.4 對(duì)供應(yīng)鏈的影響 117
4.3 如何利用農(nóng)業(yè)大數(shù)據(jù) 118
4.4 大數(shù)據(jù)與遺傳育種 118
4.4.1 基因組輔助育種技術(shù) 119
4.4.2 作物基因組與遺傳改良 124
4.4.3 經(jīng)濟(jì)動(dòng)物基因組及遺傳改良 137
4.5 農(nóng)業(yè)信息管理 139
4.5.1 作物品種資源數(shù)據(jù)庫(kù) 140
4.5.2 動(dòng)物遺傳資源數(shù)據(jù)庫(kù) 140
4.5.3 農(nóng)業(yè)有害生物數(shù)據(jù)庫(kù) 141
4.6 智能化管理農(nóng)場(chǎng)網(wǎng)絡(luò) 142
4.6.1 智能化農(nóng)業(yè)生產(chǎn)管理 142
4.6.2 農(nóng)產(chǎn)品物流信息管理 142
4.6.3 農(nóng)產(chǎn)品信息回溯 143
4.7 結(jié)合中國(guó)國(guó)情，促進(jìn)精細(xì)農(nóng)業(yè)與大數(shù)據(jù)融合 145
4.8 農(nóng)業(yè)大數(shù)據(jù)的美好未來(lái) 146
第5章 大數(shù)據(jù)時(shí)代的倫理隱憂(yōu) 148
5.1 基因組信息涉及的倫理隱私 148
5.1.1 倫理學(xué)問(wèn)題 148
5.1.2 基因信息與身份識(shí)別 148
5.1.3 基因信息可能暴露意外的親緣關(guān)系 149
5.1.4 基因信息可用于推測(cè)個(gè)人特征 149
5.1.5 基因信息可能導(dǎo)致基因歧視 149
5.1.6 基因信息可能導(dǎo)致保險(xiǎn)公司歧視性定價(jià)策略 150
5.2 什么類(lèi)型的基因檢測(cè)更容易存在倫理隱患？ 150
5.2.1 單基因檢測(cè) 151
5.2.2 疾病的基因檢測(cè) 151
5.2.3 全外顯子、全基因組檢測(cè)或檢測(cè)位點(diǎn)非常多的芯片檢測(cè) 151
5.2.4 親子鑒定、司法鑒定 151
5.3 如何注意避免泄露基因隱私 152
5.3.1 了解檢測(cè)目的 152
5.3.2 閱讀知情同意書(shū)和條款，保護(hù)自身權(quán)利 152
5.3.3 了解檢測(cè)所使用的技術(shù)手段 152
5.4 大數(shù)據(jù)時(shí)代生命倫理展現(xiàn)價(jià)值維度 152
5.4.1 生命倫理學(xué)的出現(xiàn)及其研究范疇 153
5.4.2 生命倫理學(xué)原則 154
5.4.3 大數(shù)據(jù)時(shí)代的醫(yī)學(xué)倫理與信息安全 155
主要參考文獻(xiàn) 161