計算機輔助藥物設(shè)計實驗教程

定　價：￥52.00

作　者：	羅海彬，張晨編
出版社：	中山大學出版社
叢編項：
標　簽：	暫缺

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ISBN：	9787306073518	出版時間：	2021-12-01	包裝：	平裝
開本：	16開	頁數(shù)：	146	字數(shù)：

內(nèi)容簡介

　　本書共分為五章內(nèi)容。第一章介紹定量構(gòu)效關(guān)系，并針對選擇性環(huán)氧合酶抑制劑開展三維定量構(gòu)效關(guān)系研究實驗。第二章以******受體酪氨酸激酶抑制劑為例，對基于藥效團模型虛擬篩選進行了詳細的講解。第三章由七個獨立的子實驗組成，內(nèi)容涵蓋了點群計算、單電能計算、靜電勢表面計算等，以方便讀者熟悉和掌握小分子的多種結(jié)構(gòu)優(yōu)化操作。第四章為分子對接，集中講解了四種常用對接方法的實驗操作，方便讀者掌握不同對接方法的軟件操作和結(jié)果分析。第五章以“普瑞巴林”和“MDM2-抑制劑復合物”為研究對象，對分子動力學模擬實驗操作進行講解。

作者簡介

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圖書目錄

第一章定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)
一、實驗?zāi)康?br /> 二、實驗要求
三、實驗原理
1 比較分子力場分析方法(CoMFA)
2 比較分子相似性指數(shù)分析方法((CoMSIA)
四、實驗內(nèi)容
1 背景介紹
2 實驗操作
【參考文獻】
第二章藥效團模型
一、實驗?zāi)康?br /> 二、實驗要求
三、實驗原理
1 藥效團特征的種類
2 藥效團模型的構(gòu)建
3 基于藥效團模型藥物設(shè)計方法的應(yīng)用
四、實驗內(nèi)容
1 背景介紹
2 實驗操作
【參考文獻】
第三章結(jié)構(gòu)優(yōu)化
一、實驗?zāi)康?br /> 二、實驗要求
三、實驗原理
四、實驗內(nèi)容
1 構(gòu)建化合物并優(yōu)化結(jié)構(gòu)
2 保證水分子的C2v1點群
3 保證Ge6的Dh對稱性計算
4 同分異構(gòu)體的單點能計算
5 靜電勢表面ESF(Electrostatic potential surfaces)計算
6 觀察分子振動
7 預測紅外光譜和拉曼光譜
第四章分子對接
一、實驗?zāi)康?br /> 二、實驗要求
三、實驗原理
四、實驗內(nèi)容
1 LibDock對接方法及蛋白一配體相互作用的打分評價
2 CDOCKER和對接姿態(tài)分析
3 SYBYL軟件的分子對接模塊Smflex-Dock
4 MOE軟件的分子對接模塊I)ock
5 總結(jié)
【參考文獻】
第五章分子動力學模擬
一、實驗?zāi)康?br /> 二、實驗要求
三、實驗原理
四、實驗內(nèi)容
1 普瑞巴林的溶劑化模型及分子動力學模擬
2 MIDM2一抑制劑復合物的分子動力學模擬
【參考文獻】