甘蔗分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)

前言
第一章 常用分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)
第一節(jié) 常用菌株和質(zhì)粒
第二節(jié) 常用培養(yǎng)基
一、根癌農(nóng)桿菌培養(yǎng)基
二、大腸桿菌培養(yǎng)基
三、SOC培養(yǎng)基
四、MS（Murashige and Skoog）培養(yǎng)基
第三節(jié) 常用抗生素
第四節(jié) 常用溶液與緩沖液
第五節(jié) 常用微生物學(xué)實(shí)驗(yàn)方法
一、常用菌株培養(yǎng)條件
二、菌株保存方法
三、菌種的復(fù)蘇
四、菌種的接種、傳代
第六節(jié) 細(xì)菌DNA操作
一、細(xì)菌DNA的提取
二、細(xì)菌DNA的酶切
第七節(jié) 甘蔗DNA操作
一、甘蔗總DNA的提取
二、甘蔗DNA的酶切、純化、沉淀和電泳
第八節(jié) 甘蔗RNA操作
一、甘蔗總RNA的提取
二、甘蔗總RNA的DNase I處理
三、甘蔗總RNA濃度測(cè)定
四、甘蔗總RNA反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
第九節(jié) 聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）
一、普通PCR
二、溫度不對(duì)稱嵌套PCR（TAIL-PCR）
三、實(shí)時(shí)定量PCR（QRT-PCR）
第十節(jié) 蛋白質(zhì)實(shí)驗(yàn)技術(shù)
一、甘蔗總蛋白質(zhì)的提取
二、甘蔗總蛋白質(zhì)的SDS-PAGE電泳
第十一節(jié) 分子雜交技術(shù)
一、Southern雜交
二、Northern雜交
三、Western雜交
第二章 DNA分子標(biāo)記技術(shù)
第一節(jié) 相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性（SRAP）
一、SRAP標(biāo)記的原理
二、SRAP分子標(biāo)記的技術(shù)流程
第二節(jié) 目標(biāo)起始密碼子多態(tài)性（SCoT）
一、SCoT標(biāo)記的原理
二、SCoT標(biāo)記的引物設(shè)計(jì)
三、SCoT-PCR擴(kuò)增
第三節(jié) 簡(jiǎn)單重復(fù)序列間擴(kuò)增（ISSR）
一、ISSR標(biāo)記的原理
二、ISSR標(biāo)記的引物設(shè)計(jì)
三、ISSR-PCR擴(kuò)增
第四節(jié) 擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性（AFLP）
一、AFLP標(biāo)記的原理
二、AFLP標(biāo)記操作流程
第五節(jié) 簡(jiǎn)單重復(fù)序列（SSR）
一、SSR標(biāo)記的原理
二、SSR標(biāo)記操作流程
第六節(jié) 表達(dá)序列標(biāo)簽（EST）
一、EST數(shù)據(jù)庫(kù)資源
二、植物EST數(shù)據(jù)的分析應(yīng)用
第七節(jié) 單核苷酸多態(tài)性（SNP）
一、SNP標(biāo)記的優(yōu)點(diǎn)、特點(diǎn)
二、SNP的發(fā)現(xiàn)
三、SNP在作物遺傳育種上的應(yīng)用
第三章 甘蔗遺傳轉(zhuǎn)化
第一節(jié) 常用植物表達(dá)載體介紹
–、pBI 101
二、pBI 121
三、pBI 221
四、pCAMBIA3301
五、PL515-86
六、Ｎ-PL539-4
七、N-PL538-92
八、pCAMBIA1300
九、pCAMBIA1301
十、pCAMBIA1302
十-、pCAMBIA3300
十二、pART27
第二節(jié) 甘蔗組織培養(yǎng)
第三節(jié) 甘蔗的農(nóng)桿菌遺傳轉(zhuǎn)化
第四節(jié) 基因槍轟擊法甘蔗遺傳轉(zhuǎn)化
第四章 基因組原位雜交與顯微檢測(cè)技術(shù)
第一節(jié) 甘蔗染色體的核型分析（形態(tài)觀察法）
第二節(jié) 甘蔗雜交后代基因組原位雜交技術(shù)（GISH）
第三節(jié) 甘蔗組織的石蠟切片技術(shù)（附HE染色方法）
第四節(jié) 甘蔗組織冷凍切片技術(shù)
第五節(jié) 甘蔗細(xì)胞骨架觀察方法（免疫熒光法）
第六節(jié) 甘蔗花粉的收集和保存方法
第七節(jié) 甘蔗花粉數(shù)量的計(jì)數(shù)方法
第八節(jié) 甘蔗花粉生活力的測(cè)定
一、形態(tài)觀察法
二、碘-碘化鉀法
三、藍(lán)墨水染色法
四、TTC檢測(cè)法
五、培養(yǎng)基發(fā)芽法
第九節(jié) 甘蔗柱頭可授性檢測(cè)方法（聯(lián)苯胺-過氧化氫法）
第五章 組學(xué)分析
第一節(jié) 基因組測(cè)序
第二節(jié) 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
第三節(jié) Small RNA測(cè)序
第四節(jié) circRNA測(cè)序
第五節(jié) 蛋白質(zhì)組學(xué)
第六節(jié) 蛋白質(zhì)修飾組學(xué)
第七節(jié) 代謝組學(xué)
第六章 甘蔗病害分子檢測(cè)技術(shù)
第一節(jié) 甘蔗黑穗病分子檢測(cè)技術(shù)
一、甘蔗黑穗病簡(jiǎn)介
二、甘蔗黑穗病分子檢測(cè)技術(shù)概覽
第二節(jié) 甘蔗梢腐病分子檢測(cè)技術(shù)
一、甘蔗梢腐病簡(jiǎn)介
二、甘蔗梢腐病病原菌的分子檢測(cè)步驟
第三節(jié) 甘蔗花葉病分子檢測(cè)技術(shù)
一、甘蔗花葉病簡(jiǎn)介
二、甘蔗花葉病分子檢測(cè)技術(shù)概覽
三、甘蔗花葉病分子檢測(cè)技術(shù)方法
第四節(jié) 甘蔗黃葉病分子檢測(cè)技術(shù)
一、甘蔗黃葉病介紹
二、甘蔗黃葉病分子檢測(cè)方法
第五節(jié) 甘蔗白條病分子檢測(cè)技術(shù)
一、甘蔗白條病介紹
二、甘蔗白條病分子檢測(cè)方法
第六節(jié) 甘蔗宿根矮化病分子檢測(cè)技術(shù)
一、甘蔗宿根矮化病簡(jiǎn)介
二、甘蔗宿根矮化病分子檢測(cè)步驟
第七章 常用分子生物學(xué)分析工具
第一節(jié) SnapGene
第二節(jié) DNAMAN使用簡(jiǎn)介
第三節(jié) Primer Premier 5
第四節(jié) 從NCBI查找感興趣的基因
第五節(jié) 利用Compute pI/Mw tool計(jì)算序列等電點(diǎn)和分子量的工具
第六節(jié) 利用TMHMM網(wǎng)站預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)跨膜結(jié)構(gòu)
第七節(jié) MEGA5-系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
主要參考文獻(xiàn)
附錄1 一些常用單位符號(hào)及換算
附錄2 縮略語表