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內(nèi)容簡介

　　本書從R語言臨床預測模型基本原理講起，逐步深入到進階實戰(zhàn)，并配合實戰(zhàn)案例，重點介紹臨床預測模型的構建、評價、驗證，讓讀者可以快速領悟 3~5分預測模型 SCI（science citation index，科學引文索引）的套路與精髓，為后續(xù)沖擊10分以上SCI打基礎。本書分為13章，主要內(nèi)容有線性回歸、Logistic回歸、Cox回歸、競爭風險模型等；自變量篩選方法有傳統(tǒng)方法、逐步回歸法、Lasso法、隨機森林法、最優(yōu)子集法、主成分分析法等；模型可視化涉及多種形式的列線圖、Calibration校準曲線、ROC、DCA 曲線等圖形繪制，不僅涉及單模型的可視化，還涉及單模型多時點、多模型同時點的可視化；模型評價指標涉及C指數(shù)、AUC、NRI、IDI 等；模型驗證主要涉及簡單交叉驗證、K折交叉驗證、留一法交叉驗證及Bootstrap法。本書內(nèi)容通俗易懂，案例豐富，實用性強，適合R語言臨床預測模型的入門讀者和進階讀者，尤其是臨床、護理、公共衛(wèi)生、藥學等專業(yè)的碩士研究生和博士研究生或從事相關研究的科研人員閱讀。另外，本書還可以作為相關培訓機構的教材。

作者簡介

　　彭獻鎮(zhèn)，南京醫(yī)科大學康達學院流行病與統(tǒng)計學系主任，研究方向為慢性病流行病學，擔任江蘇省預防醫(yī)學會青年委員，在國內(nèi)外發(fā)表20余篇學術論文，主持各級科研課題7項；擅長SPSS、Stata、SAS、GraphPad Prism、PASS、R、Amos 等多種軟件的統(tǒng)計分析建模工作，實戰(zhàn)經(jīng)驗豐富，創(chuàng)建大鵬統(tǒng)計工作室至今，已為5000余名碩士研究生、博士研究生提供統(tǒng)計分析、科研設計服務。

圖書目錄

第1章臨床預測模型概述 1
1.1 如何構建預測模型 2
1.1.1 先單后多 2
1.1.2 逐步回歸 2
1.1.3 Lasso 2
1.1.4 隨機森林 3
1.1.5 最優(yōu)子集 3
1.2 如何評價預測模型 3
1.2.1 擬合優(yōu)度檢驗 3
1.2.2 ROC 4
1.2.3 Calibration 4
1.2.4 DCA曲線 4
1.3 如何驗證預測模型 4
1.3.1 交叉驗證 5
1.3.2 Bootstrap法 5
1.4 小結 5
第2章線性回歸 6
2.1 線性回歸概述 7
2.1.1 相關的概念 7
2.1.2 回歸的概念 9
2.2 線性回歸實戰(zhàn) 11
2.2.1 簡單線性回歸 11

IV
2.2.2 多重線性回歸 17
2.3 小結 25
第3章 Logistic回歸 27
3.1 概述 28
3.1.1 二分類Logistic回歸的基本原理28
3.1.2 多分類Logistic回歸的基本原理30
3.1.3 有序Logistic回歸的基本原理30
3.1.4 1∶m匹配條件Logistic回歸的基本原理31
3.2 Logistic回歸分析實戰(zhàn) 31
3.2.1 二分類Logistic回歸 31
3.2.2 多分類Logistic回歸 41
3.2.3 有序Logistic 49
3.2.4 1∶m匹配條件Logistic 53
3.3 小結 56
第4章生存資料分析 59
4.1 概述 60
4.1.1 Kaplan-Meier生存曲線的基本原理60
4.1.2 Cox比例風險模型的基本原理 61
4.2 生存資料分析實戰(zhàn) 62
4.2.1 Kaplan-Meier生存曲線 62
4.2.2 Cox比例風險模型 72
4.3 小結 81
第5章競爭風險模型 83
5.1 概述 84
5.2 競爭風險模型實戰(zhàn) 85
5.2.1 Fine-Gray檢驗（單因素分析） 85
5.2.2 crr()函數(shù)法（多因素分析） 95

V
目錄
5.3 小結 97
第6章自變量篩選 99
6.1 傳統(tǒng)方法 100
6.1.1 基于連續(xù)性資料 100
6.1.2 基于二分類資料 105
6.1.3 基于生存資料 112
6.2 逐步法 116
6.2.1 基于連續(xù)性資料 117
6.2.2 基于二分類資料 121
6.2.3 基于多分類資料 124
6.2.4 基于有序資料 126
6.2.5 基于1∶m匹配資料 128
6.2.6 基于生存資料 130
6.2.7 基于競爭風險資料 131
6.3 Lasso法 134
6.3.1 基于連續(xù)性資料 135
6.3.2 基于二分類資料 144
6.3.3 基于多分類資料 151
6.3.4 基于生存資料 160
6.4 隨機森林法 167
6.4.1 基于連續(xù)性資料 168
6.4.2 基于二分類資料 172
6.4.3 基于多分類資料 177
6.4.4 基于生存資料 180
6.4.5 基于競爭風險資料 187
6.5 最優(yōu)子集法 191
6.5.1 基于連續(xù)性資料 192
6.5.2 基于二分類資料 193
6.5.3 基于多分類資料 193
6.5.4 基于有序資料 196
6.5.5 基于生存資料 196

VI
6.5.6 基于競爭風險資料 198
6.6 主成分分析法 200
6.7 小結 204
第7章列線圖205
7.1 列線圖簡介 206
7.2 基于連續(xù)資料 206
7.2.1 普通靜態(tài)列線圖 206
7.2.2 網(wǎng)頁動態(tài)列線圖 210
7.2.3 花樣列線圖 212
7.2.4 靜態(tài)列線圖的變種 215
7.3 基于二分類資料 216
7.3.1 普通靜態(tài)列線圖 216
7.3.2 網(wǎng)頁動態(tài)列線圖 222
7.3.3 花樣列線圖 223
7.3.4 靜態(tài)列線圖的變種 227
7.4 基于有序資料 228
7.4.1 普通靜態(tài)列線圖 228
7.4.2 花樣列線圖 233
7.4.3 靜態(tài)列線圖的變種 236
7.5 基于生存資料 237
7.5.1 普通靜態(tài)列線圖 237
7.5.2 網(wǎng)頁動態(tài)列線圖 246
7.5.3 花樣列線圖 248
7.5.4 靜態(tài)列線圖的變種 253
7.5.5 生存概率列線圖 255
7.6 基于競爭風險模型 256
7.6.1 普通靜態(tài)列線圖 256
7.6.2 靜態(tài)列線圖的變種 264
7.6.3 生存概率列線圖 265
7.6.4 花樣列線圖 266
7.7 小結 270

第8章 Calibration校準曲線 271
8.1 Calibration校準曲線簡介 272
8.2 基于二分類資料 272
8.2.1 單一模型校準曲線 272
8.2.2 多模型校準曲線 281
8.3 基于生存資料 284
8.3.1 單模型單時點校準曲線 285
8.3.2 單模型多時點校準曲線 292
8.3.3 多模型同時點校準曲線 294
8.4 基于競爭風險模型 299
8.4.1 單模型單時點校準曲線 299
8.4.2 多模型同時點校準曲線 301
8.5 小結 304
第9章 C指數(shù)計算 305
9.1 C指數(shù)簡介 306
9.2 基于二分類資料 306
9.3 基于生存資料 310
9.4 基于競爭風險模型 315
9.5 小結 318
第10章 ROC曲線 319
10.1 ROC曲線簡介 320
10.2 基于二分類資料 320
10.2.1 單一模型ROC曲線 320
10.2.2 多模型ROC曲線 328
10.3 基于生存資料 332
10.3.1 單模型單時點ROC曲線 332
10.3.2 單模型多時點ROC曲線 336
10.3.3 多模型同時點ROC曲線 339

VIII
10.4 基于競爭風險模型343
10.4.1 單模型單時點ROC曲線 343
10.4.2 單模型多時點ROC曲線 345
10.4.3 多模型同時點ROC曲線 348
10.5 小結 349
第11章 DCA曲線 350
11.1 DCA曲線簡介 351
11.2 基于二分類資料351
11.2.1 單一模型DCA曲線351
11.2.2 多模型DCA曲線356
11.3 基于生存資料359
11.3.1　單模型單時點DCA曲線 359
11.3.2　單模型多時點DCA曲線 363
11.3.3　多模型同時點DCA曲線 365
11.4 小結 368
第12章 NRI、IDI計算 369
12.1 NRI、IDI簡介 370
12.2 基于二分類資料 370
12.3 基于生存資料 378
12.4 小結 384
第13章交叉驗證及Bootstrap 385
13.1 概述 386
13.2 簡單交叉驗證 389
13.3 K折交叉驗證 391
13.4 留一法交叉驗證 393
13.5 Bootstrap 395
13.6 小結 397