棉花基因組學

目錄
前言
**章 棉花基因組調(diào)研與組裝 1
**節(jié) 基因組調(diào)研 1
第二節(jié) 基因組測序與組裝 7
第三節(jié) 基因組可視化與注釋 22
第四節(jié) 棉花基因組組裝案例 29
參考文獻 31
第二章 棉花二倍體基因組研究 34
**節(jié) 棉花二倍體基因組概述 34
第二節(jié) 棉花二倍體基因組大事記 35
第三節(jié) 雷蒙德氏棉基因組研究進展 41
第四節(jié) 亞洲棉基因組研究進展 46
第五節(jié) 澳洲棉基因組研究進展 52
第六節(jié) 瑟伯氏棉和戴維遜氏棉基因組研究進展 56
第七節(jié) 特納氏棉基因組研究進展 66
第八節(jié) 草棉基因組研究進展 67
第九節(jié) 長萼棉基因組研究進展 69
第十節(jié) 異常棉基因組研究進展 70
第十一節(jié) 司篤克氏棉基因組研究進展73
第十二節(jié) 比克氏棉基因組研究進展74
第十三節(jié) 圓葉棉、亞洲棉、雷蒙德氏棉基因組研究進展82
參考文獻 90
第三章 異源四倍體棉花基因組研究 92
**節(jié) 異源四倍體棉花基因組研究現(xiàn)狀 92
第二節(jié) 陸地棉基因組測序研究進展 99
第三節(jié) 海島棉基因組研究進展 134
第四節(jié) 其他四倍體棉花基因組研究進展 138
參考文獻 146
第四章 棉花種質(zhì)資源與變異組學研究 149
**節(jié) 中國棉花種質(zhì)資源概況 149
第二節(jié) 全轉(zhuǎn)錄組關聯(lián)分析 157
第三節(jié) 亞洲棉變異組及重要性狀遺傳基礎解析 160
第四節(jié) 陸地棉變異組及重要性狀遺傳基礎解析 168
第五節(jié) 海島棉變異組研究 195
參考文獻 204
第五章 植物三維基因組學研究 207
**節(jié) 三維基因組學概述 207
第二節(jié) 三維基因組學研究技術 209
第三節(jié) 植物三維基因組層級結(jié)構(gòu) 219
第四節(jié) 三維基因組數(shù)據(jù)分析 228
第五節(jié) 三維基因組可視化 236
第六節(jié) 植物三維基因組研究進展 238
第七節(jié) 展望 240
參考文獻 240
第六章 棉花的表觀遺傳學研究 251
**節(jié) 表觀遺傳學的發(fā)展、定義和分類 251
第二節(jié) 表觀遺傳學的研究現(xiàn)狀 252
第三節(jié) 棉花基因組 DNA甲基化研究進展 256
第四節(jié) 棉花蛋白質(zhì)翻譯后修飾研究進展 266
第五節(jié) 棉花非編碼 RNA研究進展 276
第六節(jié) 棉花表觀修飾和多倍體基因組進化 282
第七節(jié) 表觀修飾之間的互作及其意義 290
第八節(jié) 棉花表觀遺傳研究展望 293
參考文獻 296