蝦夷扇貝殼色形成機制研究

前言
章 貝類殼色研究進展
一、貝類殼色的多態(tài)性及重要功能
（一）貝類殼色的多態(tài)性
（二）貝類殼色的重要功能
二、貝類殼色產(chǎn)生的原因
（一）環(huán)境對貝類殼色的影響
（二）貝類殼色的化學(xué)本質(zhì)
（三）結(jié)構(gòu)致色
三、貝類殼色的遺傳
四、貝類殼色形成的分子機制
（一）基因組層面——殼色相關(guān)分子標(biāo)記的開發(fā)
（二）貝類殼色形成的轉(zhuǎn)錄組水平研究
（三）貝類殼色形成的蛋白質(zhì)組水平的研究
（四）其他組學(xué)層面的研究
（五）殼色形成相關(guān)分子通路
五、貝類殼色在遺傳育種中的應(yīng)用
（一）貝類殼色與生長發(fā)育的關(guān)系
（二）貝類殼色與營養(yǎng)成分的關(guān)系
（三）以殼色為目標(biāo)性狀的貝類新品種選育
第二章 蝦夷扇貝生物學(xué)及遺傳育種
一、蝦夷扇貝生物學(xué)
二、蝦夷扇貝養(yǎng)殖概況
（一）蝦夷扇貝在日本的養(yǎng)殖現(xiàn)狀
（二）蝦夷扇貝在中國的養(yǎng)殖現(xiàn)狀
（三）蝦夷扇貝養(yǎng)殖中存在的問題
三、蝦夷扇貝遺傳育種進展
（一）群體遺傳學(xué)
（二）選擇育種
四、蝦夷扇貝殼色多態(tài)性及新品種選育
第三章 蝦夷扇貝殼色形成組織外套膜的組織學(xué)研究
一、貝類的外套膜組織
二、蝦夷扇貝外套膜不同區(qū)域的組織學(xué)研究
（一）蝦夷扇貝邊緣膜的組織結(jié)構(gòu)特點
（二）蝦夷扇貝中央膜的組織結(jié)構(gòu)特點
三、不同殼色蝦夷扇貝外套膜組織學(xué)比較
第四章 蝦夷扇貝殼色形成組織外套膜的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
一、轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)
二、蝦夷扇貝外套膜不同區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
（一）蝦夷扇貝外套膜轉(zhuǎn)錄組測序及拼接
（二）蝦夷扇貝外套膜轉(zhuǎn)錄組功能注釋
（三）蝦夷扇貝外套膜不同區(qū)域的基因差異表達分析
三、蝦夷扇貝外套膜不同區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
第五章 不同殼色蝦夷扇貝的蛋白質(zhì)組學(xué)研究
一、蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)
二、不同殼色蝦夷扇貝外套膜蛋白質(zhì)組學(xué)分析
（一）不同殼色蝦夷扇貝外套膜的蛋白質(zhì)組測定
（二）不同殼色蝦夷扇貝外套膜的差異蛋白表達分析
第六章 不同殼色蝦夷扇貝的表觀遺傳學(xué)研究
一、DNA甲基化概述
二、不同殼色蝦夷扇貝全基因組DNA甲基化分析
（一）不同殼色蝦夷扇貝外套膜WGBS測序
（二）不同殼色蝦夷扇貝外套膜全基因組甲基化圖譜的繪制
（三）兩種殼色蝦夷扇貝甲基化胞嘧啶附近的序列特征分析
（四）兩種殼色蝦夷扇貝基因組不同區(qū)域的甲基化模式分析
（五）兩種殼色蝦夷扇貝差異甲基化區(qū)域分析
第七章 蝦夷扇貝殼色形成相關(guān)基因的序列及功能研究
一、黑色素形成通路相關(guān)基因
（一）蝦夷扇貝Tyr基因家族
（二）蝦夷扇貝MITF基因
二、血紅素合成通路基因
第八章 研究展望
參考文獻