馬乾，昆明人。崇禎六年(1633)中鄉(xiāng)舉，為四川廣安知州。夔州告急，巡撫邵捷春命乾代行知府之職。張獻(xiàn)忠圍攻夔州二十余日，督師楊嗣昌兵至才解圍。升乾為川東兵備僉事。成都為農(nóng)民軍攻克，巡撫龍文光戰(zhàn)死。蜀人共推馬乾代行巡撫事。農(nóng)民軍轉(zhuǎn)攻重慶，留其將劉廷舉守成都，為乾所擊敗，退出成都。督師王應(yīng)熊彈劾馬乾軍劫掠平民。被奪職審訊。這時四川已大亂，朝廷詔命不到，乾仍照舊行巡撫事，傳令遠(yuǎn)近州郡合力御敵。廷舉軍撤走后，農(nóng)民軍劉文秀師數(shù)萬人進(jìn)攻成都。乾竭力固守，直到曾英的援兵到才解成都之圍。獻(xiàn)忠死后，其部將孫可望南下。清兵進(jìn)至重慶，馬乾戰(zhàn)敗而死。