最后漢口樂(lè)善堂竟然發(fā)展成以漢口樂(lè)善堂為中心，在湖南、四川、北京分別設(shè)有支部，具體由荒尾精、山內(nèi)線、高橋謙、宗方小太郎負(fù)責(zé)的一個(gè)龐大間諜網(wǎng)。當(dāng)時(shí)加入這一間諜組織的日本浪人從裝束、發(fā)辮到語(yǔ)言都仿照中國(guó)人，以江湖各種職業(yè)為掩護(hù)，流竄于中國(guó)內(nèi)地各省，包括北京、蒙古、伊犁、滿洲、陜西、廣東、廣西、云南、貴州、新疆、西藏等地，其行蹤幾乎遍布中國(guó)全境。

隨著隊(duì)伍的壯大，漢口樂(lè)善堂的調(diào)查范圍也漸漸擴(kuò)大，涉及到中國(guó)各地氣候風(fēng)土、人情風(fēng)俗、工商農(nóng)業(yè)、交通金融、清朝兵制、被服糧秣等方面，所寫(xiě)的報(bào)告書(shū)--“對(duì)每一個(gè)村莊、每一條道路、每一座小丘甚至于水井，都標(biāo)示得清清楚楚”。此外，漢口樂(lè)善堂還積極接觸白蓮教、哥老會(huì)、九龍會(huì)等民間社團(tuán)，拉攏其中的立場(chǎng)不堅(jiān)定分子，隨時(shí)準(zhǔn)備在中國(guó)境內(nèi)掀起滔天巨浪。

就像一顆楔入的巨型鋼釘，漢口樂(lè)善堂這個(gè)間諜機(jī)構(gòu)牢牢固定在中國(guó)腹地，源源不斷地向日本輸送回大量情報(bào)。1890年4月，表現(xiàn)不俗的荒尾精回到日本匯報(bào)成果，將漢口樂(lè)善堂交于日本陸軍參謀本部派來(lái)的大尉根津一接管。后來(lái)根津一將大堆的情報(bào)分類整理，匯成2編3冊(cè)2300多頁(yè)的《清國(guó)通商綜覽》，在1892年正式出版。這本書(shū)涉及到中國(guó)的政治、經(jīng)濟(jì)、文化、地理、交通等諸多方面，為日本后來(lái)的侵華活動(dòng)提供了第一手資料。

回國(guó)后的荒尾精于1890年9月又帶著從日本各地征召來(lái)的150名“頭腦優(yōu)秀、身體強(qiáng)健”的學(xué)生再度入境，在上海開(kāi)辦起了另一家日清貿(mào)易研究所。

日清貿(mào)易研究所的前身是東洋學(xué)館，于1884年7月成立，“此學(xué)館在上海設(shè)立的目的決不是造就普通的學(xué)者，而是教授漢語(yǔ)、英語(yǔ)，熟練地進(jìn)行東洋貿(mào)易，培養(yǎng)實(shí)業(yè)家，爭(zhēng)取最大的國(guó)家利益。支那是和日本關(guān)系重大、有無(wú)盡財(cái)源的大國(guó)，是日本國(guó)獲取利益的最好的市場(chǎng)。從事這些，就要通漢語(yǔ)和東洋貿(mào)易以及必要的英語(yǔ)?！彼澈蟮馁Y助者也是岸田吟香，不過(guò)時(shí)運(yùn)不濟(jì)，成立一年后即因經(jīng)費(fèi)緊張關(guān)門(mén)大吉了。

荒尾精這次有備而來(lái)，因?yàn)楣ぷ鞒錾玫搅舜ㄉ喜倭氖卓?，還獲得4萬(wàn)日元的特別經(jīng)費(fèi)。有了資金有了生源，日清貿(mào)易研究所很快就有聲有色地開(kāi)辦起來(lái)?；奈簿匀嗡L(zhǎng)，如有事外出時(shí)，所內(nèi)事務(wù)則全部轉(zhuǎn)由根津一處理。為了便于管理，他還將全部學(xué)員分為三個(gè)班，每班配備一名干事，分別由宗方小太郎、小山秋作和西村忠一擔(dān)任，宗方小太郎還兼任學(xué)生監(jiān)督；漢口樂(lè)善堂成員中西正樹(shù)、山內(nèi)巖、高橋謙、田鍋安之助、片山敏彥、井深彥三郎等擔(dān)任顧問(wèn)或中國(guó)問(wèn)題教師；中國(guó)人沈文藻和桂林講授漢語(yǔ)；英國(guó)人阿斯托則講授英語(yǔ)，此外還開(kāi)設(shè)了商業(yè)地理、中國(guó)商業(yè)史、經(jīng)濟(jì)學(xué)、日漢文學(xué)等課程。修業(yè)年限為四年，前三年學(xué)習(xí)學(xué)科知識(shí)，最后一年則實(shí)習(xí)或?qū)嵉乜疾臁＿@樣，它就與漢口樂(lè)善堂有了明顯分工，漢口樂(lè)善堂的主要任務(wù)是搜集情報(bào)和偵察中國(guó)各地情況，日清貿(mào)易研究所則偏重培養(yǎng)訓(xùn)練軍事間諜。

日清貿(mào)易研究所開(kāi)學(xué)后沒(méi)持續(xù)多久，就有幾乎一半的學(xué)員因經(jīng)費(fèi)困難而中途離去。到了1893年，第一期89名學(xué)員還未畢業(yè)，中日關(guān)系已到一觸即發(fā)之時(shí)，根津一開(kāi)始發(fā)表講話：“兩國(guó)戰(zhàn)局已經(jīng)劍拔弩張，此戰(zhàn)乃以富強(qiáng)自詡的清帝國(guó)為對(duì)手，對(duì)日本來(lái)說(shuō)不容樂(lè)觀。所幸者，諸君通曉支那語(yǔ)，又多少通曉支那之事，故希望諸君能夠暗探敵軍軍情及其內(nèi)情，以為皇國(guó)效力?！痹诮虇T的強(qiáng)力鼓動(dòng)下，所有學(xué)員于5月份盡數(shù)分散隱匿，大多數(shù)都改扮成華僑或僧人，分別奔赴北京、天津、煙臺(tái)、江蘇、浙江、四川、福建、臺(tái)灣等處。

甲午戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)前夕，他們或單一行動(dòng)或三五成群，再扮成儒士、商人、僧人、乞丐等各類角色，四處刺探軍情，其中史上記載的人物有向野堅(jiān)一、山崎羔三郎、藤崎秀、大鵬熊、豬田正吉以及在上海法租界被捕的福原林平和楠內(nèi)友次郎等。待到甲午戰(zhàn)爭(zhēng)爆發(fā)后，這批學(xué)員中有72人充任隨軍翻譯，上了前線，日清貿(mào)易所的活動(dòng)才算正式結(jié)束。

在中日近代戰(zhàn)爭(zhēng)的前期，漢口樂(lè)善堂與日清貿(mào)易研究所起到了巨大作用。從西鄉(xiāng)隆盛發(fā)起對(duì)華間諜戰(zhàn)到這兩家間諜機(jī)構(gòu)的楔入，日本間諜已從成功地探路者轉(zhuǎn)變?yōu)闈B透者，這不能不說(shuō)是他們的一次勝利。