秩父宮在關(guān)鍵時刻站到天皇一邊，令整個皇室松了一口氣。但秩父宮與叛亂事件的關(guān)系仍有許多未解之謎，許多重臣仍對他心存疑慮?！岸笔录^去兩年后，元老西園寺還對身邊的人說：“若目前這種政治氣氛一直繼續(xù)下去，其結(jié)果很難預(yù)料。日本歷史上也發(fā)生過許多令人厭惡的事。比如，神武天皇的后繼者綏靖天皇就是弒兄君而后稱帝的。這類事情在日本歷史上不勝枚舉。當然，這不是說現(xiàn)在的皇族中有這樣的人，不過，今后對這種事應(yīng)多加注意?！?

28日，天皇一再催促，“地區(qū)居民撤退還需要多長時間？”“如果兵力不足，可以調(diào)動近縣的部隊”“如果增援部隊不到，不能發(fā)動進攻嗎？”“反正要盡快鎮(zhèn)壓！”在天皇的催逼下，猶豫不決的軍部終于下了決心。當晚11時，出臺了內(nèi)含討伐計劃的“戒嚴令第14號”，戒嚴令稱“反亂部隊，若不服大命，當斷然以武力恢復(fù)治安”。戒嚴令還命令各有關(guān)部隊在次日上午5時之前做好攻擊準備。戒嚴令發(fā)布后，近衛(wèi)、第1、第14師團和近縣的部隊約25萬人被調(diào)進東京將叛軍包圍起來，機槍已架好，坦克昂起了炮口，裝甲車在來回示威，停泊在東京灣的海軍軍艦也將大炮對準了叛軍的陣地。

眼看大勢已去，唯恐自己受到牽連的真崎來到叛軍之中勸說道：“各位如果繼續(xù)堅持下去，勢必成為皇軍的罪人，我勸你們還是歸順吧！”說罷匆匆離去。

失去了皇道派上層人物的支持，叛亂軍人沒了主心骨。面對重兵的包圍，他們意識到敗局已定，如果繼續(xù)抵抗下去，為天皇而舉兵的名義就將失去，而且還要永遠背負逆賊的罵名。想到此處，將校們相抱痛哭。根據(jù)栗原中尉的提案，山下少將含淚和川島陸相奔赴宮城，向本莊武官提出了最后一項要求，為了證明發(fā)動叛亂是為天皇而戰(zhàn)，請?zhí)旎逝沙鰵J差，在欽差監(jiān)視下，以痛快的自裁光榮地結(jié)束自己的生命。

當本莊向天皇說明叛軍的要求后，遭到了天皇的斷然拒絕：“如欲自殺，任其自便，給這種人派欽差，真是荒謬之至。”過不多久，侍衛(wèi)長再次就派遣欽差一事奏請?zhí)旎?，但裕仁根本不予理會：“朕只能認為他們是為了私利私欲，才如此膽大妄為的?！?

29日上午7時10分，戒嚴司令部命令三宅坂、赤坂見附、溜池、虎之門、櫻田門一帶的居民撤離?；哪尽⒄嫫閮晌淮髮楸苊馀衍姴筷犜獾轿溲b鎮(zhèn)壓，前往戒嚴司令部進行交涉，但遭到拒絕。戒嚴司令部的答復(fù)是：如果叛軍繼續(xù)違抗命令，部隊將于下午1時發(fā)起攻擊。8時，有戰(zhàn)斗機開始向叛軍撒投降傳單，但傳單隨風(fēng)飄蕩，并沒有落到叛軍所在地。于是，戒嚴司令部改用播音的方式向叛軍傳達戒嚴司令部的“告士兵書”：“書告下士官與士兵：從現(xiàn)在起應(yīng)各歸原隊，仍為時不晚；凡抵抗者均屬逆賊，將予以槍決；汝等的父母兄弟亦將成為國賊，為此都在哭泣。”

在嚴冬中堅持了3天的叛亂軍人此時已疲憊不堪，士氣消沉。聽到廣播后，他們紛紛脫離叛軍返回了原來的部隊。策動叛亂的軍官們見大勢已去，也未加阻止。除野中四郎自殺外，其余軍官全部在下午1時后投降，河野大尉后來在醫(yī)院自殺。2時過后，陸軍的杉山參謀次長和香椎戒嚴司令官進宮將平息叛軍之事上奏天皇。就這樣，一場史無前例的兵變，在裕仁天皇堅決鎮(zhèn)壓的方針下終于得以平息。

由于這場政變直接威脅到了天皇的統(tǒng)治權(quán)，因此，對叛亂軍人的懲處也異乎尋常地嚴厲。3月4日，裕仁天皇發(fā)布敕令：“朕茲鑒于緊急需要，依憲法第8條第1項，批準成立東京陸軍軍法會議”，特決定“將其作為特設(shè)軍法會議”。在成立軍法會議之時，天皇極其嚴厲地講道：“如果再采取像對待相澤中佐（青年軍官，在陸軍省用刀劈死軍務(wù)局長永田鐵山少將）那種優(yōu)柔的態(tài)度，相反會后患無窮。因此這次軍法會議的審判長及審判官一定要正確、嚴厲地處理這些將校！”在天皇的指示下，特設(shè)軍法會議在非公開、一審制、無須辯護律師的情況下，對叛亂者進行了秘密審判。