就在陳獨(dú)秀在秘書(shū)長(zhǎng)職位上如魚(yú)得水的時(shí)候，陳家卻遭遇了塌天大禍。一天，14歲的長(zhǎng)子陳延年跑進(jìn)都督府，找到陳獨(dú)秀，氣喘吁吁地告訴他說(shuō)：

“家里出事了，爺爺病了”

陳獨(dú)秀愣了一下。

自從第一次離家東渡日本，陳獨(dú)秀對(duì)家中事便很少過(guò)問(wèn)。但以前經(jīng)常返家，即使遠(yuǎn)在日本也是如此。自從與高君曼離家出走，便再也沒(méi)有回過(guò)家，直到返回安慶，才回家看望了一下嗣父、嗣母。家中五個(gè)子女，除次女夭折外，其他三子一女一直由嗣父、嗣母和發(fā)妻高曉嵐照顧。但如今嗣父在病中，家里能主事的男人只剩了他一個(gè)，嗣母只好請(qǐng)他回家商量。

原來(lái)，陳衍庶兩年前做的那筆大豆生意，原以為案情早已了結(jié)，不料突然接到英商訴訟狀，要求陳衍庶交還收購(gòu)大豆的訂金，可訂金早已在合同撤銷(xiāo)之時(shí)清還，陳衍庶又氣又急，病情驟然加重。

陳獨(dú)秀回到家中，聽(tīng)完嗣母講述的這些情況，望著病榻上的嗣父，一時(shí)無(wú)語(yǔ)。

對(duì)于嗣父做著清廷的官，陳獨(dú)秀一直耿耿于懷，但嗣父畢竟養(yǎng)活了一大家子人。嗣父在東北任上發(fā)財(cái)、置辦產(chǎn)業(yè)、建造“陳家大洋房”，讓全家人生活無(wú)憂，陳獨(dú)秀無(wú)話可說(shuō)。而對(duì)嗣父吃官司一事，陳獨(dú)秀也并不是很關(guān)心，尤其對(duì)做生意打官司這些事他根本一竅不通，面對(duì)嗣父、嗣母殷切的目光，他只好無(wú)能為力地表示：

“還是父親親自去一趟上

陳衍庶滿指望陳獨(dú)秀能夠代勞，沒(méi)想到陳獨(dú)秀說(shuō)出這樣一番話，想想也不無(wú)道理，失望之余，只好表示：

“好吧，看來(lái)也只有我自己去了?！?/p>

陳衍庶拖著病體去上海交涉，查閱當(dāng)年合同后才知道，姚通事欺負(fù)他不懂英文，與英商串通一氣，在退款文件上做了手腳。事已至此，陳衍庶百口莫辯，只好揮淚交出財(cái)產(chǎn)契約，一生積蓄毀于一旦，回到安慶，便一頭栽倒在床上，從此大病不起。

為了避免全部家當(dāng)賠光，嗣母謝氏先后幾次赴京，找曾子固求情，后經(jīng)曾子固交涉，總算保下了南水關(guān)兩棟房子和貴池縣賣(mài)不掉的300畝薄地。陳家未交夠的部分，由曾子固代繳補(bǔ)齊結(jié)案。好在當(dāng)初陳衍庶未將北京、奉天兩處古玩店做抵押，總算留下一點(diǎn)家產(chǎn)維持生計(jì)。

受此打擊，陳衍庶病情迅速惡化，于1913年5月18日病逝。

陳獨(dú)秀回家料理嗣父后事，也算盡了孝道。但為了避免別人說(shuō)他與舊官僚有牽連，影響革命，料理完嗣父后事，他去宗祠辦理了“退繼”手續(xù)。

他以為嗣父不在了，沒(méi)有人會(huì)在意這個(gè)手續(xù)，反正也不會(huì)影響他與嗣母的關(guān)系。不料嗣母謝氏很快得知這一消息，立刻將陳獨(dú)秀叫回家中，一見(jiàn)面便大哭不止，嘶啞著嗓子喊道：

“你不認(rèn)爹娘了嗎？皇帝也要認(rèn)爹娘的”

陳獨(dú)秀只好耐心解釋，可謝氏就是無(wú)法理解，她瞪大眼睛，不敢相信站在面前的陳獨(dú)秀是她養(yǎng)大、寵大的兒子。

事實(shí)上，陳獨(dú)秀并沒(méi)有受到家庭的“牽連”，反倒是他給這個(gè)家?guī)?lái)一場(chǎng)災(zāi)難。

1913年8月末，孫中山為反袁發(fā)動(dòng)的“二次革命”失敗，袁世凱令心腹倪嗣沖出任安徽督軍，倪嗣沖一上任，便于10月21日通告緝拿陳獨(dú)秀。當(dāng)時(shí)高君曼剛生下他們的第二個(gè)孩子兒子——陳鶴年不久，陳獨(dú)秀便攜高君曼及一兒一女逃往上海。不料，走了和尚走不了廟，倪嗣沖抓不到陳獨(dú)秀，便派人查抄陳獨(dú)秀的家，并抓捕陳獨(dú)秀的兒子。

這一天是10月27日，謝氏在前一晚得到消息，立刻吩咐陳獨(dú)秀的長(zhǎng)子、次子陳延年與陳喬年乘夜色逃走，兩個(gè)孩子連夜跑到淥水鄉(xiāng)堂親陳遐文家，這才躲過(guò)一劫。第二天搜查的人來(lái)到陳家后，搶走陳家?guī)准靛X(qián)古玩。由于陳慶元的兒子陳永年與陳喬年同齡，搜查的人認(rèn)定陳永年就是陳獨(dú)秀的兒子，無(wú)論謝氏怎樣解釋，還是將陳永年帶走了。后來(lái)證實(shí)陳永年不是陳獨(dú)秀的兒子，才同意由保人出面將他保釋回家。