楊巨源，字子淵，他的祖先是成都人。他父親楊信臣，客居在益昌，于是他家住在益昌。楊巨源灑脫有大志，善于騎馬射箭，涉獵諸子百家的書(shū)籍。考進(jìn)士不中，考武舉又不中。劉光祖見(jiàn)他認(rèn)為他是奇才，把他推薦給總領(lǐng)錢(qián)糧陳曄，以重要的職位推舉他為鳳州堡子原倉(cāng)官，楊巨源馳騁射獵，拿出自己的財(cái)產(chǎn)養(yǎng)士，沿邊的忠義人，都佩服他的才能。讓他分管魚(yú)關(guān)糧料院，轉(zhuǎn)為監(jiān)興州合江贍軍倉(cāng)。

　　吳曦反叛，楊巨源暗有討賊的志向，交結(jié)義士三百人，給他們錢(qián)、糧。游奕軍統(tǒng)領(lǐng)張林，能挽兩石的弓，隊(duì)將朱邦寧身高六尺，勇力超人，都被吳曦忌恨，雖然屢立戰(zhàn)功也不加以獎(jiǎng)賞，張林等對(duì)吳曦不滿。當(dāng)時(shí)張林在..口，朱邦寧在合江，楊巨源就和他們加強(qiáng)聯(lián)系，并招集忠義人朱福、陳安、傅檜等。

　　吳曦脅迫安丙為丞相長(zhǎng)史，安丙稱(chēng)自己有病，眉州士大夫程夢(mèng)錫見(jiàn)安丙，安丙嘆道：“世事如此，世間沒(méi)有豪杰！”程夢(mèng)錫就談到楊巨源的計(jì)劃。安丙說(shuō)“：他肯來(lái)見(jiàn)我嗎？”就囑托程夢(mèng)錫送信給楊巨源，請(qǐng)他到安丙的住所。楊巨源問(wèn)：“先生就是逆賊的丞相長(zhǎng)史嗎？”安丙號(hào)哭說(shuō)“：目前的兵將，我知道他們不能奮起平叛。一定得是你這樣的豪杰，才能平滅這個(gè)叛賊，那么安丙沒(méi)有憂慮了?！睏罹拊磫?wèn)“：先生的主意已定了嗎？”安丙指天發(fā)誓說(shuō)：“如果能誅殺這個(gè)叛賊，即使死也是忠鬼，還有什么遺憾！”楊巨源十分高興，說(shuō)：“除了先生，別人不能主持這事，除了我楊巨源，別人不能了卻這事?！?br />
　　這時(shí)，李好義、李好問(wèn)也結(jié)交李貴、楊君玉、李坤辰等數(shù)十人，李坤辰邀請(qǐng)楊巨源與李好義會(huì)合一處。楊巨源又十分高興地說(shuō)“：我與安長(zhǎng)史商議在三月六日邀吳曦去拜廟，會(huì)合勇士刺殺他?！崩詈昧x說(shuō)“：吳曦出行時(shí)就清理道路，他的扈從有千人，事情一定難成功。聽(tīng)說(shuō)他在熟食日祭祀東園，謀取他應(yīng)該在這時(shí)候?！睏罹拊赐?。李好義希望見(jiàn)安丙一面來(lái)確定真假。楊巨源說(shuō)“：我今天先對(duì)安長(zhǎng)史說(shuō)這事，明日在偽宮，讓長(zhǎng)史問(wèn)你的祖先就是。”楊巨源把這事告訴安丙，第二天，李好義在偽宮見(jiàn)安丙，向他施禮。安丙說(shuō)：“從前我與你父親是同僚，楊省干富有才略，早晚要委以職事。”他們殺吳曦的計(jì)劃就確定了。

　　楊君玉先委托他的同鄉(xiāng)白子申草擬詔書(shū)，文辭不符合訓(xùn)誡的話，楊巨源更改了它，照例蓋上合江倉(cāng)的紅印。楊巨源、李好義擔(dān)心事情泄露，就在開(kāi)禧三年二月二十九日，天沒(méi)亮?xí)r，李好義率他的部下沖入偽宮，楊巨源拿著詔書(shū)、騎著馬，自稱(chēng)是朝廷使臣，進(jìn)入?yún)顷氐膶嬍?，吳曦開(kāi)門(mén)想逃，李貴抓住并殺死了他。吳曦的衛(wèi)兵開(kāi)始還抵抗，聽(tīng)說(shuō)有詔書(shū)就都退去。楊巨源、李好義迎接安丙宣讀詔書(shū)，用吳曦的頭示眾。三軍推舉安丙權(quán)四川宣撫使，楊巨源權(quán)參贊軍事。安丙向朝廷奏功，把楊巨源排在第一，皇上下詔楊巨源補(bǔ)為承事郎。

　　楊巨源對(duì)安丙說(shuō)：“吳曦死了，賊膽已破，關(guān)外四州是蜀的要害，應(yīng)該乘勢(shì)收復(fù)。”李好義也這么說(shuō)。安丙擔(dān)心軍中沒(méi)有現(xiàn)成的糧草，楊巨源極力講不奪取四州，必有后患，自己請(qǐng)求為隨軍措置糧運(yùn)。于是安丙分別派李好義收復(fù)西和州，張林、李簡(jiǎn)收復(fù)成州，劉昌國(guó)收復(fù)階州，孫忠銳收復(fù)大散關(guān)。不久詔命楊巨源升為朝奉郎，差遣為通判，兼任四川宣撫使司參議官。安丙一向討厭孫忠銳，聽(tīng)說(shuō)孫忠銳在大散關(guān)失守，傳檄召他回來(lái)，想廢掉他，安丙先命令楊巨源同朱邦寧一起率兩千人去策應(yīng)。楊巨源到鳳州，趁孫忠銳出來(lái)迎接之機(jī)，在帳幕后埋伏壯士，突然出來(lái)殺了孫忠銳和他的兒子孫揆。安丙就以孫忠銳附會(huì)吳曦，進(jìn)獻(xiàn)賀表為罪名上告給朝廷，并且自己等待處治。

　　先前，獎(jiǎng)諭誅叛賊的詔書(shū)到達(dá)沔州，楊巨源對(duì)人說(shuō)“：詔命中沒(méi)一個(gè)字提及楊巨源，懷疑有掩蓋我功勞的人?！辈痪脗鱽?lái)授予王喜節(jié)度使的消息，楊巨源更加不平。這時(shí)趙彥吶因在夔州殺死祿禧而得到州通判的官職，楊巨源說(shuō)：“殺祿禧給通判的官職，殺吳曦也給通判嗎？”楊巨源用書(shū)函感謝安丙說(shuō)“：魯仲連寫(xiě)信勸燕將撤守，幫助齊國(guó)收復(fù)了聊城，不受齊王的封爵，我十分敬慕他的高尚行為；陶淵明不為五斗米折腰，棄去彭澤令的官印而歸隱，成就他的清風(fēng)亮節(jié)?！彼峙扇说匠⒃V說(shuō)自己的功勞，又慫恿興元都統(tǒng)彭輅給韓..胄寫(xiě)信，彭輅明里答應(yīng)，暗中報(bào)告了安丙。有人說(shuō)楊巨源和他的部下米福、車(chē)彥威謀劃作亂，安丙命令王喜審訊他們，米福、車(chē)彥威都獲罪。正將陳安又告發(fā)楊巨源集結(jié)敢死士入關(guān)，想燒沔州州治，等安丙出來(lái)就殺了他。安丙綜合以前的事，就想除去楊巨源，但沒(méi)什么確鑿的證據(jù)。

　　恰好楊巨源在鳳州給金國(guó)鳳翔都統(tǒng)使送去檄書(shū)，其中的話像是用了間諜，并自稱(chēng)是宣撫副使而用參議官的印蓋在上面。金國(guó)給安丙送檄書(shū)。楊巨源正和金人作戰(zhàn)，在長(zhǎng)橋失敗，安丙就給楊巨源寫(xiě)信讓他回來(lái)，楊巨源懷疑。梁泉主簿高岳成，是楊巨源推薦他當(dāng)隨軍撥運(yùn)的，他來(lái)見(jiàn)楊巨源，支持他回去，楊巨源相信了他。

　　這時(shí)彭輅已到沔州，六月二十八日，楊巨源回到幕府，安丙密令彭輅抓楊巨源。楊巨源一點(diǎn)都不知道，以為他是來(lái)拜見(jiàn)自己，談完話，彭輅起身告辭，楊巨源送他到客舍。武士拉住他的衣服，楊巨源還呵斥他們，但已被驅(qū)逐到庭下。楊巨源大喊道“：我有什么罪？”安丙隔著屏障派人對(duì)他說(shuō)“：你為什么詐稱(chēng)是宣撫副使？”下令把他押送到閬州監(jiān)獄。楊巨源說(shuō)“：我一時(shí)使用間諜，他時(shí)一定有替我講明這事的?！卑脖o他送去酒菜，楊巨源說(shuō)“：我一身無(wú)愧，死也不遺憾；只是有個(gè)妹妹沒(méi)出嫁，希望宣撫想著這事。”二十九日，楊巨源的船到達(dá)大安龍尾灘，將校樊世顯把船叫上岸，楊巨源知道將被殺死，就指著這塊地對(duì)他說(shuō)：“這是一塊好的葬身之地。”樊世顯說(shuō)“：哪有這種事？”船行了數(shù)步，樊世顯對(duì)楊巨源說(shuō)：“宣參口渴了很久，難道不喝杯酒？”楊巨源推辭。又說(shuō)：“宣參戴著枷鎖已很久了，何不稍微松一下？”楊巨源沒(méi)來(lái)得及回答，他左右的人就拿利刀砍他的頭，有一寸多沒(méi)砍斷，于是就以楊巨源是自殺的向宣撫司報(bào)告。以后數(shù)日，安丙下令埋葬他。

　　楊巨源死后，忠義之士都替他惋惜，聽(tīng)說(shuō)的人都流淚，劍外士人張伯威做祭文悼念他，言辭十分悲切。楊巨源的屬吏李壁在政府，聽(tīng)說(shuō)后說(shuō)：“唉，楊巨源他死啦！”安丙因人情洶洶，上章辭職。楊輔也認(rèn)為安丙殺楊巨源一定會(huì)招致變亂，請(qǐng)求用劉甲代替安丙。當(dāng)初，楊巨源和李好義同官軍聯(lián)合，安丙秘密做反正的計(jì)策，各不相知，聯(lián)合楊巨源于李好義的是李坤辰，而聯(lián)合李好義于安丙的是楊巨源。楊巨源給劉光祖寫(xiě)信，講述了安丙酬答的話，被刻成書(shū)競(jìng)相傳播，安丙已不高興，再加上讒言不斷，終于積成此禍。

　　成忠郎李珙投書(shū)朝廷，獻(xiàn)上所做的《楊巨源傳》替他訴冤，朝廷也感念他的功勞，賜廟褒獎(jiǎng)他的忠心，賜為寶謨閣待制，給他的兩個(gè)兒子官職。制置使崔與之請(qǐng)求官府安葬他，加贈(zèng)他為寶謨閣直學(xué)士、太中大夫。嘉熙元年(1237)，理宗特別賜他謚號(hào)為“忠愍”。他的兒子楊履正最終的官職是大理卿、四川制置副使。