義師至新林，仙琕猶持兵于江西，日鈔運(yùn)漕，建康城陷，仙琕號哭經(jīng)宿，乃解兵歸罪。高祖勞之曰：“射鉤斬袪，昔人弗忌。卿勿以戮使斷運(yùn)，茍自嫌絕也?！毕涩V謝曰：“小人如失主犬，后主飼之，便復(fù)為用?！备咦嫘Χ乐６矶涩V母卒，高祖知其貧，賻給甚厚。仙琕號泣，謂弟仲艾曰：“蒙大造之恩，未獲上報(bào)。今復(fù)荷殊澤，當(dāng)與爾以心力自效耳。”

天監(jiān)四年，王師北討，仙琕每戰(zhàn)，勇冠三軍，當(dāng)其沖者，莫不摧破。與諸將論議，口未嘗言功。人問其故，仙琕曰：“丈夫?yàn)闀r(shí)所知，當(dāng)進(jìn)不求名，退不逃罪，乃平生愿也。何功可論！”授輔國將軍、宋安、安蠻二郡太守，遷南義陽太守。累破山蠻，郡境清謐。以功封浛洭縣伯，邑四百戶，仍遷都督司州諸軍事、司州刺史，輔國將軍如故。俄進(jìn)號貞威將軍。

魏豫州人白皂生殺其刺史瑯邪王司馬慶曾，自號平北將軍，推鄉(xiāng)人胡遜為刺史，以懸瓠來降。高祖使仙琕赴之，又遣直閣將軍武會(huì)超、馬廣率眾為援。仙琕進(jìn)頓楚王城，遣副將齊茍兒以兵二千助守懸瓠。魏中山王元英率眾十萬攻懸瓠，仙琕遣廣、會(huì)超等守三關(guān)。十二月，英破懸瓠，執(zhí)齊茍兒，遂進(jìn)攻馬廣，又破廣，生擒之，送雒陽。仙琕不能救。會(huì)超等亦相次退散，魏軍遂進(jìn)據(jù)三關(guān)。仙琕坐征還，為云騎將軍。出為仁威司馬，府主豫章王轉(zhuǎn)號云麾，復(fù)為司馬，加振遠(yuǎn)將軍。

十年，朐山民殺瑯邪太守劉晣，以城降魏，詔假仙琕節(jié)，討之。魏徐州刺史盧昶以眾十余萬赴焉。