智顗在玉泉寺四年，主要講《法華玄義》和《摩訶止觀》，然后由灌頂記錄整理成書，成為天臺宗的主要經(jīng)典?！斗ㄈA玄義》是對《法華經(jīng)》的理解，《摩訶止觀》是講禪法的。摩訶是梵文，意為大，“止”為停息，“觀”是智慧。是指教理與修證兩大部門，稱教觀二門。

看來智顗是一心要在創(chuàng)立宗派上做文章的，在江都，只能是楊廣的家僧，所以他要離開。他在這里收了很多弟子。據(jù)說他一生造寺三十六所，度僧一萬四千余人，親傳弟子三十二人。在玉泉寺就有不少。大概是他比較開心的時候，講《妙法蓮華經(jīng)》一個“妙”字，能講九十多天。

開皇十三年（公元593年）二月二十二日，楊廣入朝，行至陜州（治所今河南陜縣），又遣使送去親筆信往荊州奉迎智顗，稱自己“馳仰之誠與時而積”，越來越想念了。

五月，智顗派弟子奉書報晉王，送上新建玉泉伽藍（寺廟）圖，獻上相傳是外國獻給梁武帝的珍貴“萬春樹皮袈裟”。楊廣收到禮物后就修書一封表示感謝，并以豐厚的禮單表示回報。文帝也敕書匾額，賜智顗創(chuàng)辦的精舍名曰“玉泉寺”，并敬問道體，也就是身體如何。

荊州繼任總管王積慌了神，急忙隨即到山上禮拜，境況大為改觀了。據(jù)說王積上山禮拜，見到智顗后渾身出汗、顫抖。王積身經(jīng)百戰(zhàn)，未曾怵過，此次竟會這樣，令人非常不解。

楊廣始終想著要智顗入江都。又三番寫信派人迎接智顗，一定要見到師父。沒有辦法，智顗只好在595年二月到了金陵。

智顗始終不愿住進慧日道場，先到金陵棲霞寺，后又來到江都城外禪眾寺。大概就是不愿做楊廣的籠中鳥。面對智顗的風骨，楊廣轉(zhuǎn)而希望大師傳授佛法。兩次修書向智顗問禪法，很可能想成為智者傳燈弟子，智者頻辭不免，乃著《凈名經(jīng)疏》，此經(jīng)疏是對《維摩詰經(jīng)》作的注解。

七月，智顗以所著《凈名經(jīng)疏·初卷》奉送晉王，楊廣很高興地接受了，但他進一步要智顗授禪傳燈卻遭到了斷然拒絕。其后一段時間，智顗的活動受到了監(jiān)視。這從他去世前寫給楊廣的信中可以看出。“今出期既斷，法門亦絕。”不讓他出去傳法，法門就絕了。他很憤慨，這是信中“六恨”之一，也是人們對智顗死因猜測的一個依據(jù)。